运输发票开具方法如下：
1、运送企业提供运送劳务公司自主开具的交通运输业统一发票；
2、由自开税票经营者开具的交通运输业统一发票；
3、由代开票经营者开具的交通运输业统一发票；
4、运送企业负责人地方税务局及省地方税务局委托的代开票发票中介公司机构为运送企业和个人代开票的运送发票准许抵税；
5、被确认为自开税票经营者的货运企业和货运物流企业开具的货运运输发票也准许计算抵税进项税；
6、别的企业代运送单位和个人开具的运送发票一律不可抵税。
运输发票税额：对增值税一般纳税人外购货物或销售货物（固定资产除外）所支付的运输费用（代垫运费除外），根据运费结算单据（普通发票）所列运费金额，依9%的扣除率计算进项税额准予扣除，但随同运费支付的装卸费、保险费等其他杂费不得计算扣除进项税额。
普通发票和运输发票的区别如下：
1、普通发票是指在购销商品、提供或接受服务以及从事其他经营活动中，所开具和收取的收付款凭证；
2、运输发票是对增值税一般纳税人外购货物或销售货物（固定资产除外）所支付的运输费用（代垫运费除外），根据运费结算单据（普通发票）所列运费金额，依7%的扣除率计算进项税额准予扣除，但随同运费支付的装卸费、保险费等其他杂费不得计算扣除进项税额。
法律依据
《中华人民共和国发票管理办法》
第二十二条 开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖发票专用章。
任何单位和个人不得有下列虚开发票行为：
（一）为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；
（二）让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；
（三）介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票。