一、易受国际进口贸易保护者的抵制。随着跨境电商海外仓的建设，大批量商品的进口对本国传统商业带来影响，使得利益相关者产生抵制倾向，加之我国商品在知识产权、产品安全等方面的诸多缺陷，面临的贸易纠纷更加频繁。
二、海外仓构建下企业需要负责外贸、货物清关等诸多事项，由于传统目的地国的进口贸易由海外进口商完成，但对于海外仓物流配送模式，这些手续由跨境电商自负办理。同时，在清关方式上，传统小包由邮政来完成，而对于海外仓批量发货，走大宗货物清关方式，要求更严格，认证体系更繁琐。
三、对跨境电商的管理、服务能力要求更高。从海外仓经营管理过程来看，货物交由海外仓运营主体来进行管理，并负责仓储、物流、配送业务，由此需要对货物进行快捷、准确、实时化管理，所需的信息技术水平更高。
跨境电商海外仓的发展，还面临诸多阻力。我们要从各个方面来发挥海外仓优势，逐一破解劣势难题，不断构建以满足海内外消费者良好的购物体验的海外仓模式。