电子商务在企业生产过程中的应用，可在管理信息系统(MIS)的基础上采用计算机辅助设计与制造(CAD/CAM)，建立计算机集成制造系统(GIMS);可在开发决策支持系统(DSS)的基础上，通过人机对话实施计划与控制，从物料资源规划(MRP)发展到制造资源规划(MRP?II)和企业资源规划(ERP)。这些新的生产方式把信息技术和生产技术紧密地融为一体，使传统行业受到了前所未有的挑战；
二，构建电子商务环境
适应电子商务的发展企业电子商务建设和功能的充分实现离不开企业内部的信息化建设。目前中国企业普遍存在的信息化基础落后与网络和电子商务技术的现代化形成了巨大反差，已经不适应甚至阻碍了中国企业电子商务的应用与发展；
三，缺乏完整的商业服务体系
由于缺乏完整的商业服务体系，目前我国企业间B2B、电子商务的运行中，还没有一个多元化、集成化的商业服务联盟，虽然我国在物流配送方面已不断完善，但还是显的心有余而力不足；
四，电子商务服务应用不深入
现阶段电子商务不能够深入到对企业价值链的应用中进行，不能够支持电子商务对企业价值链的整合，造成电子商务服务应用各自为政、离散无序的局面；
五，商业服务标准不统一
由于缺乏统一的行业标准，企业之间、各电子商务运营商之间往往是各自为政，规范及商品代码的不同，致使许多信息无法在所有网络之间真正实现共享等诸多挑战。