法律主观：
一、哪些普通发票也能抵扣进项税（一）通行费增值税电子普通发票自2018年1月1日起，纳税人支付的道路通行费，按照收费公路通行费增值税电子普通发票上注明的增值税额抵扣进项税额。申报表填写栏次：增值税一般纳税人取得符合规定的通行费电子发票后，应当自开具之日起360日内登录本省（区、市）增值税发票选择确认平台,查询、选择用于申报抵扣的通行费电子发票信息。在纳税申报时填入《增值税纳税申报表附列资料（二）》（本期进项税额明细）中“认证相符的增值税专用发票”相关栏次中。（二）通行费纸质发票（不含财政票据）1、2018年1月1日至12月31日，纳税人支付的一级、二级公路通行费，如暂未能取得收费公路通行费增值税电子普通发票，可凭取得的通行费发票上注明的金额按下列公式计算抵扣进项税额：可抵扣进项税额=一级、二级公路通行费发票上注明的金额÷（1+5%）×5%2、纳税人支付的桥、闸通行费，暂凭取得的通行费发票上注明的收费金额按照下列公式计算抵扣的进项税额：可抵扣进项税额=桥、闸通行费发票上注明的金额÷（1+5%）×5%申报表填写栏次：在纳税申报时填入《增值税纳税申报表附列资料（二）》（本期进项税额明细）中第8b栏“其他”中。农产品收购发票是指纳税人向农业生产者个人购买自产农产品时，使用税控设备开具的增值税普通发票，在发票左上角自动打印“收购”字样。农产品销售发票是指农业生产者销售自产农产品适用免征增值税政策而开具的普通发票。纳税人购进农产品，取得（开具）农产品销售发票或收购发票的，按以下公式计算抵扣进项税额：可抵扣的进项税额=农产品买价*10%。申报表填写栏次：在纳税申报时填入《增值税纳税申报表附列资料（二）》（本期进项税额明细）中第6栏“农产品收购发票或者销售发票”中。纳税人购进用于生产销售或委托受托加工16%税率货物的农产品，按照12%的扣除率计算进项税额，除填写第6栏“农产品收购发票或者销售发票”外，加计扣除部分还需填入《增值税纳税申报表附列资料（二）》（本期进项税额明细）中第8a栏“加计扣除农产品进项税额”中。自2013年7月1日起，一般纳税人进口货物取得的属于增值税扣税范围的海关缴款书，经税务机关稽核比对相符后，准予按注明的增值税额进行抵扣。申报表填写栏次：纳税人已申请稽核但尚未取得稽核相符结果的海关缴款书进项税额填入《增值税纳税申报表附列资料（二）》（本期进项税额明细）第30栏“海关进口增值税专用缴款书”。纳税人已申请稽核且稽核相符结果的海关缴款书进项税额填入《增值税纳税申报表附列资料（二）》（本期进项税额明细）第5栏"海关进口增值税专用缴款书"。一般纳税人从境外单位或者个人购进服务、无形资产或者不动产，按照规定应当扣缴增值税的，可以凭解缴税款取得的完税凭证抵扣注明的进项税额。纳税人凭完税凭证抵扣进项税额的，应当具备书面合同、付款证明和境外单位的对账单或者发票，资料不全的不得抵扣。申报表填写栏次：《增值税纳税申报表附列资料（二）》（本期进项税额明细）第7栏"代扣代缴税收缴款凭证"。二、待抵扣进项税额怎么处理1、理论上业务处理时，应该是取得进项发票入账，并且在入账当月认证所以待抵扣进项，应该是当月销项不够时才会发生，而不应该出现没有认证待抵扣的进项税额。这样，进项税入账时的分录应该是：借：原材料（或直接进费用的管理费用）应交税费－应交增值税－进项贷：应付账款2、月末，当应交增值税借方余额大于贷方余额时，如果是因为进项大于销项，则不予结转，也不用交增值税，自动延期到次月抵扣如果借方大于贷方是因为预缴了增值税，也就是已交税额大于销项税额时，则应该结转进未交增值税科目，分录：借：应交税费－未交增值税贷：应交税费－应交增值税－转出多交增值税3、如果因各种原因，当进项税额多需待抵扣，又如果是辅导期，月末把已认证的进项税额，需要下月比对后抵扣的部分，结转到待抵扣进项税额。
法律客观：2007年7月1日起施行的《中华人民共和国农民专业合作社法》确立了农民专业合作社的法律地位。为促进农民专业合作社的健康发展，国家相继出台了一些税收优惠政策。如某屠宰厂（系一般纳税人）从某生猪养殖专业合作社（系一般纳税人）购进生猪（系农民专业合作社成员生产的免税农业产品），取得的增值税普通发票能否抵扣？依据《财政部、国家税务总局关于农民专业合作社有关税收政策的通知》（财税〔2008〕81号）规定：对农民专业合作社销售本社成员生产的农业产品，视同农业生产者销售自产农业产品免征增值税。增值税一般纳税人从农民专业合作社购进的免税农业产品，可按13％的扣除率计算抵扣增值税进项税额。该文件并未明确依据何种发票抵扣进项税额。而《财政部、国家税务总局关于免征部分鲜活肉蛋产品流通环节增值税政策的通知》（财税〔2012〕75号）第三条明确规定：“《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条所列准予从销项税额中扣除的进项税额的第（三）项所称的‘销售发票’，是指小规模纳税人销售农产品依照3％征收率按简易办法计算缴纳增值税而自行开具或委托税务机关代开的普通发票。批发、零售纳税人享受免税政策后开具的普通发票不得作为计算抵扣进项税额的凭证”。此文件的出台有点“下位法规范上位法”的味道，缩小了《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条界定的范围。因此，属于一般纳税人的生猪养殖专业合作社开具免税的增值税普通发票不能作为屠宰厂抵扣进项税额的凭证。结合前后文件规定容易让人产生这样的误解：屠宰厂只能向生猪养殖专业合作社开具农产品收购发票，才能据以计算抵扣进项税额。而该生猪养殖专业合作社是有能力自行开具发票的纳税人，这么做显然不妥，却又没有否定的政策依据。由于农产品收购发票由纳税人自开自抵，存在很大的弊端。为进一步规范农产品增值税进项税额扣除，堵塞征管漏洞，国家税务总局先后在部分行业试行农产品增值税进项税额核定扣除办法，取消农产品收购发票只是时间问题。如果全面推行农产品增值税进项税额核定扣除办法，上述问题就迎刃而解了。但在目前，笔者还是建议上级机关尽快出台政策，明确一般纳税人从农民专业合作社购进免税农产品凭何种发票抵扣进项，减少征纳双方矛盾，降低基层执法风险，切实落实惠农政策，更好扶持农业发展。