保税区清关，主要指的是国家目前批准的12个跨境电商试点城市的保税区，此种通关模式适用的税率是跨境电商综合税。跨境电商综合税的关税部分是暂时为零，进口环节的增值税和消费税按照实际应缴纳税额的70%征收。最终折算出来大部分的纸尿裤、厨具、食品、箱包等常见品类的综合税率为11.9%。单个包裹的货值限制在2000元以内，每个收件人年度交易额限定20000元。
天津港保税区的跨境电商还不错。保税区跨境电商产业继续保持跨越式发展态势，实现逆势增长，截止于2023年4月12日，保税区跨境电商进口总单量达1349.6万单。保税区跨境电商业务主要集中在空港、海港两个区域，货类以母婴、日化、美妆、食品、保健品等品类为主，进口来源国主要集中在日本、韩国、澳大利亚、新西兰等国家，经过多年的探索与发展，保税区跨境电商生态体系如今已十分完善，呈现进口模式突出、头部企业突出、物流服务突出等特点。