岳飞死后，武穆遗书一直藏于临安大内翠寒堂东十五步处水帘石洞下，后被铁掌帮帮主上官剑南盗回铁掌峰，藏于帮中圣地。《射雕英雄传》? 一书中完颜洪烈见金跟蒙古战斗屡屡不敌，希望得到遗书中用兵要决以灭蒙古及大宋。
故请得欧阳锋父子及彭连虎、沙通天等武林高手帮助，前往水洞盗书。惟他们不知遗书原本早已被铁掌帮帮主盗去，所夺得的只是一个空盒。郭靖亦为保护此书，与欧阳锋交手而至重伤；得黄蓉相助于密室疗伤七天后方愈。
郭靖与黄蓉因于牛家村曲灵风酒店中发现曲藏有遗书所在地的画，得知遗书藏于铁掌峰，并成功取得。襄阳城破后，郭靖夫妇与襄阳同生死，郭靖将杨过送予郭襄的玄铁重剑加上西方精金分别鋳成倚天剑与屠龙刀，武穆遗书即藏于屠龙刀之中。
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在杨过和小龙女夫妻暂缓襄阳之危的八年后，蒙古帝国因拖雷之长子蒙哥的死而四分五裂，拖雷之四子忽必烈在北方大都（今北京）称帝后建立元朝，后元军在阿术、刘整、阿里海牙、史天泽、和伯颜等的领导下大举南侵，决心灭宋。
郭靖在襄樊一役苦战五年；首先襄阳相邻的樊城失守，敌军用回回炮向襄阳不断地轰击，但是宰相贾似道隐瞒襄樊两城的战况及当时的皇帝宋度宗整日沉迷于酒色不问政事，使襄阳守军孤立无援。
尽管郭靖精通《武穆遗书》所载兵法，但由于实力悬殊，故郭靖与妻子意识到襄阳终会失陷、宋朝将灭于蒙古人的手中，并决意城破之日，以死殉国。
在城池快要失守时，郭靖、黄蓉托匠人将杨过夫妇给予郭家的”玄铁重剑“铸成”倚天剑“和”屠龙刀“，把指示《九阴真经》、《降龙十八掌掌法精义》所在地之一块铁片藏于”倚天剑“中；《武穆遗书》之铁片藏于”屠龙刀“中。
在江湖中开始为这两件神兵流传一句话︰”武林至尊，宝刀屠龙。号令天下，莫敢不从。倚天不出，谁与争锋。“，并寄望后人以此复国。
最终，吕文焕率诸将向元军投降，襄阳城失陷致南宋失去最后一道屏障而加快灭亡步伐，郭黄夫妇则双双壮烈殉国，贯彻其一生”为国为民，侠之大者“的高尚节操。
-武穆遗书