是应该盖总承包单位的项目部公章，因为分包单位是由总承包单位向监理单位和建设单位申报进场的，当监理单位和建设单位承认分包单位资质后，分包单位才能算正式参与项目建设，另外所有分包单位的资料都应该加盖总承包单位的公章。
施工单位进度款申请表监理盖公章有效吗
不会。询证函不具有法律诉讼效力，不影响你们之间的债权债务关系。询证函上面一般都有写这一条。
询证作为审计中一种常用的程序和方法，它包括查询和函证。查询是审计人员对有关人员进行书面或口头询问以获取审计证据的方法。函证是指审计人员为印证被审计单位会计记录所载事项而向第三者发函询证的一种方法。
企业询证函：向被审计者的债权人和债务人发出的询证函，用以检查被审计者特定日期债权或债务的存在和权利或义务。企业询证函通常包括双方在截止于特定日期的往来款项余额。
：注意
1、分清银行余额的询证和银行发生额的询证。余额是某一截止时点之前所有发生额的最终结果，通过询证银行余额可以证实截止某一时点的银行余额是否真实存在。
发生额是业务发生时的原始记录，通过询证银行发生额可以证实某一笔银行业务是否真实发生。如在验证投资人以货币资金投资时银行询证函就是对银行发生额的询证。在对资产负债表所列银行存款项目审计时银行询证函就是对银行余额的询证。
2、正确签章。发函方应该签署公章。复函方应根据实际情况分别在“数据证明无误”、“数据不符及需加说明事项”签署单位公章，并由经办人员签名或盖章。不能以单位内部机构公章代替单位公章。
3、如实填写，及时回复。发函方应根据本单位帐簿记录如实填写，作为复函方的金融机构应根据原始记录核对，按银行询证函项目逐一填写，填写完毕后及时回复至会计师事务所，并按有关规定向发函方收取询证费用。
4、注意银行询证范围。银行询证不仅包括某一截止时点有余额的银行，还包括存款、借款、托管证券、应付票据已结清的帐户。因为有可能存款帐户已结清，但仍有银行借款或其他负债存在；也有可能借款帐户已结清，但仍有未付利息。
5、询证程序要恰当。注册会计师写好询证函交给被审计单位盖章后，应亲自将询证函寄出，不可将询证函交给客户，从客户取得询证函回函要评估回函的可靠性，不可粗心大意。
6、询证工作底稿要齐备。银行询证的名单、寄发询证函的邮费单据复印件、到银行实地询证的工作记录等工作底稿要齐备，附于银行有关项目审定表下。正确运用银行询证函对于提高会计信息质量，保证银行有关项目的真实性完整性有着十分重要的意义。
询证函
一、施工单位工程款支付申请表上监理单位需要盖公章吗
需要。
工程预付款、进度款和结算款支付流程
(一)工程预付款支付流程
1、施工单位提交预付款《工程款支付申请表》给预算专员，施工单位项目经理要签字确认;
2、预算办根据合同约定的预付比例审核预付款，签署预付款《工程款支付申请表》然后交给财务部;
3、财务部再次复核后，交给总经理和董事长审批，然后将审核审批通过的《工程款支付申请表》交给出纳安排付款。
(二)工程进度款支付流程：
1、施工单位先向工程部提交进度款《工程款支付申请表》，要求附上已完工程的预算书，一式叁份(工程部、预算办、财务部各一份)，施工单位项目经理要签字。
2、工程部审核当月完成的部位及项目及相关工程量，审核完毕由工程部经理签字后交到预算专员。
3、预算专员审核已完成工程量，并审核工程预算价，确定当月完成工程造价，根据合同约定，审批工程款，然后预算专员签字确认。(注：预算办要求提供电子版预算书时，施工单位要积极配合。)
4、预算专员将进度款《工程款支付申请表》上交财务部审核。
5、财务部审核无误后，将进度款《工程款支付申请表》交由总经理和董事长审批。
6、施工单位根据审核审批通过的进度款《工程款支付申请表》中的金额开具当地建安发票，发票需按进度款《工程款支付申请表》中的工程项目分别填开。
7、施工单位将审核审批通过的进度款《工程款支付申请表》以及相同金额的建安发票上交到财务部，财务部再次复核《工程款支付申请表》的金额是否与发票金额一致，以及核对发票的各项内容后，交到出纳处办理该款项的转付。