佣金的计算不是以贸易方式为基础计算的，而是以最终双方签订的合同金额为基础计算的，有可能是FOB，也有可能是Ex-works，还有可能是CIF，具体是由收取佣金的人和支付佣金的公司在合同签订之前商定的，做得比较周全的，就是双方在合作开始的时候签订一个佣金协议，里面明确佣金的支付以合同金额为基础，佣金比率确定，然后佣金=合同金额*佣金比率。
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外贸公司的操作模式分为两种，一种是代理收取佣金，一种是自营就是赚差价。如果是自营的话就是直接从工厂买货，其他的都由贸易公司操作，收到外汇后扣除运费等费用和付给工厂的费用剩余的就是贸易公司的利润。如果是代理的话，也是外贸公司收汇，因为没有进出口权的工厂是不能收外汇的。外贸公司会扣除佣金把剩余的钱付给工厂。报关通常都是由专业的在港口的报关公司在做，可以贸易公司委托，也可以工厂委托，委托人一般是直接付款的人。报关时的贸易类型按实际成交的贸易类型报关就可以了。收汇不核销不能退税。