物流公司发货本来就有三个方面可以付款
1. 发货人付款
2. 收货人付款
3. 第三方付款
第三方付款其实也比较容易理解，例如A企业与B物流公司签订总包协议，现在A企业需要发放C地一个快件，B物流公司找的E快递公司，那么E快递公司的运费，即不是直接由发货人A支付的，也并非收货人C支付的，而是第三方B公司支付的。
另外付款方式也有许多种
1. 现付 即发货人在发货的时候支付运费
2. 到付 即收货人在收货的时候支付运费
3. 回单付 及发货人发货的时候提供一张纸质的单据，该单据经过收货人签收后，物流公司返回给发货人，发货人支付运费，这种情况一般与月结共同执行。
4. 月结，即每月固定日期进行结费
5. 首付+尾款，这可不是贷款，发货人在发货的时候先支付一部分运费，等货品完好到达目的地之后，再支付其他部分的运费。
一般1.2.情况发生较多
3.4.5一般仅仅是与该物流公司有长期稳定的合作协议之后方能采用。