2013年新的货物运输发票税率为11%（一般纳税人，连续12个月应税劳务销售额500万元及以上）、3%（小规模纳税人，连续12个月应税劳务销售额为达到500万元）。
配送服务费，增值税税率为6%，在受票方为一般纳税人并取得增值税专用发票时，受票方可按票面税额抵扣。
运费发票税额计算公式为：运费发票税额=含税票面金额÷(1+适用税率)×适用税率。
其中：
1、企业为一般纳税人时：
运费发票税额=含税票面金额÷(1+9%)×9%；
2、企业为小规模纳税人时：
运费发票税额=含税票面金额÷(1+3%)×3%。
一般纳税人提供交通运输服务的，其增值税税率为9%;企业为小规模纳税人的，则按3%征收率计算增值税;增值税交通运输业的范围包括：陆路运输服务、水路运输服务、航空运输服务、管道运输服务。