第七舰队直辖美军太平洋总部即现在的联合部队司令部指挥，其司令部设在日本的横须贺港，现任司令为约翰-伯德（John M. Bird）中将(前任为威廉-库劳德（William D. Crowder）中将)。该舰队以日本的横须贺为总指挥区，巡防区域包括西太平洋、印度洋及阿拉伯海岸，由国际日期变更线起至非洲东岸，北至千岛群岛，南至南极洲、作战区域东起国际日期变更线西至非洲东岸红海海口，南达印度洋及南极，北至白令海峡。整个作战区域13468万平方公里，比美国本土大14倍，全世界约有一半的人口处于第七舰队的作战区域内。
美军目前共有10个联合司令部，其中6个按地理划分、4个按功能划分。
按地理划分的6个联合司令部： 司令部 司令官 基地 战区及职责 美国北方司令部（USNORTHCOM） Victor Eugene Renuart Jr 上将 （美国空军） 美国科罗拉多州彼得森空军基地 北美洲、美国本土以及协助美国国土防卫、民兵等武装力量。 美国中央司令部（USCENTCOM） Martin Dempsey 中将 （美国陆军，代理） 美国佛罗里达州MacDill 空军基地 从中东、东非至中亚地区。 美国欧洲司令部（USEUCOM） Bantz J. Craddock 上将 （美国陆军，兼任欧洲盟军总司令（SACEUR）） 德国斯图加特 欧洲、土耳其、格陵兰以及俄罗斯（不包含中亚五国）。 美国太平洋司令部（USPACOM） Timothy J. Keating 上将 （美国海军） 美国夏威夷檀香山 亚洲及太平洋地区 美国南方司令部（USSOUTHCOM） James G. Stavridis 上将 （美国海军） 美国佛罗里达迈阿密 南美洲、中美洲以及周边海域。 美国非洲司令部（USAFRICOM） William E. Ward 上将 （美国陆军） 德国斯图加特 非洲（埃及除外）。 按功能划分的4个联合司令部： 司令部 司令官 基地 战区或职能 美国特种作战司令部（USSOCOM） Eric T. Olson 上将 （美国海军） 美国佛罗里达州MacDill 空军基地 为美国陆军、海军、空军以及陆战队提供特别作战支援。 美国联合部队司令部（USJFCOM） James N. Mattis 上将 （美国海军陆战队） 美国弗吉尼亚州诺福克 为其他司令部提供联合武装支援。 美国战略司令部（USSTRATCOM） Kevin P. Chilton 上将 （美国空军） 美国内布拉斯加州Offutt 空军基地 运用战略威慑力量以及协调太空武器运用。 美国运输司令部（USTRANSCOM） Norton A. Schwartz 上将 （美国空军） 美国伊利诺伊斯州Scott 空军基地 为地区司令部提供全球运输支援。