区别：
1、定义
外贸跟单员定义： 外贸跟单员是指在进出口业务中，在贸易合同签订后，依据合同和相关单证对货物加工、装运、保险、报检、报关、结汇等部分或全部环节进行跟踪或操作，协助履行贸易合同的外贸业务人员。
单证员是指在对外贸易结算业务中，买卖双方凭借在进出口业务中应用的单据、证书来处理货物的交付、运输、保险、商检、结汇等工作的人员。
2、工作内容
外贸跟单员按业务进程可分为前程跟单、中程跟单和全程跟单三大类： 前程跟单是指“跟”到出口货物交到指定出口仓库为止； 中程跟单是指“跟”到装船清关为止； 全程跟单是指“跟”到货款到账，合同履行完毕为止。跟单员按业务性质分又可分为外贸跟单和订单跟单。
单证员工作内容：收集和整理各种单证，完成送货单、订单、提单核对等对单据的各项处理，并进行基础数据录入和归档；跟踪每票货物的送货情况，统计核对相关数据；在整个过程中，完成与业务员、跟单员以及客户、货代各方面的协调沟通工作；协助参与收付汇，外汇核销以及退税的跟踪。
3、认证资格
贸跟单员，是我国商务行业继国际商务从业资格、国际货代员、国际商务单证员职业资格培训考试后第四个岗位的培训与认证考试，是外贸行业又一热门职业。
国际商务单证员全国统一考试主要是测试应试者从事国际商务单证工作必备的业务知识和能力。 国际商务单证员全国统一考试实行公开、公正、公平的原则，采取全国统一报名、统一收费标准、统一命题、统一考试、统一阅卷、统一发证的方式进行。
外贸跟单员：在国际贸易过程中，根据签订的出口商品商业合同的有关要求，选择生产加工企业的人员，指导和监督其生产进度，确保货物按照合同的要求。
外贸单证员：在国际贸易结算业务中，根据销售合同和信用证条款，从事各种外贸结算单证的编制、签发、交银行议付手续或委托银行托收等工作。
根据业务流程，外贸跟单员可分为三类：准跟单员、中间跟单员和全跟单员：准跟单员是指出口货物到达指定出口仓库前的“跟单员”，中间商是指在装运和清关之前的“跟随”，完全商是指在付款到账和合同完成之前的“跟随”，根据业务性质，跟单员可分为外贸跟单员和订单跟单员（生产跟单员）。
外贸单证员的主要工作是一系列的业务活动，如证件审核、凭证制作、单证审核、单证提交和归档等，它贯穿于进出口合同履行的全过程，具有工作量大、覆盖面广、时效性强、要求高等特点，外贸单证是指进出口业务中使用的各种单证，买卖双方用这些单据办理货物的交货、运输、保险、商检和结汇等手续。