柯桥区辖4个街道、12个镇：柯桥街道、柯岩街道、华舍街道、湖塘街道；滨海工业区（马鞍镇）、（柯桥经济开发区）齐贤镇、平水新城（平水镇）、钱清镇、杨汛桥镇、福全镇、安昌镇、兰亭镇、夏履镇、漓渚镇、王坛镇、稽东镇，共有348个行政村（居、社区），区人民政府驻柯桥街道群贤路1661号。
柯桥街道
代码：330621001邮编：312030
街道下辖29个社区（居委会），1个便民服务中心，户籍人口5.7万人，登记流动人口12.6万人，在册流动人口9万人，是柯桥区政治、经济、文化中心，素有金柯桥之美称，文化底蕴厚重，作为柯桥区水乡、桥乡、酒乡和石文化的杰出代表，柯桥街道已发展成为浙江省经济最发达的地区之一，区域内拥有亚洲最大的布匹集散中心--中国轻纺城。
柯岩街道
代码：330621002邮编：312030与柯桥主城区仅一路之隔，紧靠亚洲最大的轻纺市场--中国轻纺城，地域面积45平方公里，5.6万常住人口，8.5万外来人口，辖23个行政村、14个居委会。目前，柯岩街道正依托鉴湖柯岩风景区、高尔夫球场、乔波滑雪馆等资源，积极打造浙江省特色小镇“酷玩小镇”。
华舍街道
代码：330621003邮编：312033
地处柯桥区北部，329国道、杭甬运河、柯袍快速干线、杭金衢连接线、杭甬高速铁路客运专线在此汇集，距杭州市区45公里，杭州萧山国际机场15公里，2001年8月改镇为街道。区域面积23.05平方公里，下辖8个行政村、6个居委会、7个社区，户籍人口4.1万人，外来人口近10万人。
湖塘街道
代码：330621004邮编：312032
位于柯桥区西南部，东接柯岩街道，南连福全镇、漓渚镇和诸暨市店口镇，西邻夏履镇，北临钱清镇。距柯桥中国轻纺城4公里、越城区15公里、杭州40公里、萧山国际机场15公里。104国道南复线、鉴湖水道、柯湖公路、杭甬铁路、104国道、萧绍运河六大水陆交通线东西向纵贯境内。面积66.28平方公里，南部低山丘陵，北部水网平原。辖15个行政村、2个居委会，户籍人口3.5万人。目前正在打造浙江省特色小镇“黄酒小镇”。
滨海工业区（马鞍镇）
代码：330621104邮编：312072
位于柯桥区北部，成立于2002年6月，东起曹娥江，南连袍江工业区，西临杭州萧山区，北至钱塘江，总规划控制面积100平方公里，目前建成区面积达45平方公里，集聚人口17万。2006年3月，经浙江省人民政府批准、国家发改委核准为省级开发区。2011年，经县政府授权，托管马鞍镇。滨海工业区定位国际纺织品制造中心、全国绿色印染基地、杭州湾生态科技新城，先后荣获“长三角最具投资价值开发区”、“浙江省环境竞争力十强开发区（工业园区）”、“浙江省创新型工业园区”、“中国绿色印染研发生产基地”、“中国新型化纤研发生产基地”、中国化纤名镇、“全国第二批循环经济试点单位”、“2014年国家级园区循环化改造示范试点”等称号。
柯桥经济开发区（齐贤镇）
代码：330621100邮编：312065
柯桥经济开发区（齐贤镇）是2014年8月份按照区委、区政府的决策部署实行“区镇合一”管理体制调整的。目前，区域面积41平方公里，下辖7个村、11个居、2个社区，户籍人口5.4万余人，常住人口12万人左右。区域内大大小小企业超过2500余家，其中规上企业204家。其中，柯桥经济开发区成立于1992年9月,1993年11月经省政府批准，成为全省第一批省级重点经济开发区之一，2010年11月经省政府批准设立省级高新技术产业园区。至2012年，连续15年进入浙江省开发区综合指标考核前10强。2012年10月13日，经国务院批准升格为国家级经济技术开发区，先后荣获“长三角最具投资价值开发区”、浙江省纺织机械专业商标品牌基地、国家火炬计划绍兴纺织装备特色产业基地、中国纺织品牌展贸示范基地、浙江省高端纺织装备研发与制造特色品牌园区、浙江省首批工业循环经济示范园区、浙江省创建和谐劳动关系先进工业园区、浙江省集约用地示范开发区、浙江省开发区高端纺织装备产业园区、2014浙江“四换三名”示范开发区、“2015浙江省智慧园区”等称号。齐贤镇先后荣获浙江省百强乡镇、中国乡镇投资环境100强、全国环境优美乡镇和中国纺织机械制造名镇等称号，目前正在打造“金柯桥基金小镇”。
平水新城（平水镇）
代码：330621105邮编：312050
地处绍兴会稽山北麓，紧邻绍兴市区，地域面积173平方公里，下辖28个行政村、1个居委会，人口约7.1万，是国家综合改革发展试点镇、浙江省首批省级中心镇和绍兴市中小城市培育试点镇，先后获得省生态镇、省文明镇、省卫生镇、省森林城镇、省体育强镇、省竹林强镇、省茶叶强镇、省信用镇、省基层征兵工作先进单位、省商标品牌示范乡镇等荣誉。平水历史人文悠久，是古越国先民生息发祥之地，距今已有2000多年历史，现在仍保留着欧冶子铸剑、西施采莲遗址，秦李斯会稽刻石等历史人文遗迹,，同时生态环境良好，目前正在打造特色小镇“养生小镇”。
钱清镇
代码：330621101邮编：312025
地处杭州湾南岸，是浙江省首批27个小城市培育试点镇之一。地处杭州湾南岸，位于宁绍平原西部，东接柯桥轻纺城，西邻杭州萧山区。镇域面积53.6平方公里，下辖21个村、5个居委会，常住人口14.9万，其中户籍人口6.1万，先后被评为全国文明村镇、全国发展改革试点城镇、全国轻纺原料市场名镇。钱清现代工业虽起步较晚，然经过广大经营者努力打拼，至2003年底，钱清镇成为绍兴市第一个工业产值超百亿元的乡镇。钱清对外贸易领先全省。钱清镇外贸出口居全国乡镇第36位，浙江省第4位，1995年被列入浙江省百强乡镇的第4位。到2015年底，实现自营出口8.8亿美元，实到外资1100万美元。
杨汛桥镇
代码：330621110邮编：312028
地处柯桥区西部，是绍兴接轨杭州的“桥头堡”，距杭州中心城区25公里，距绍兴市中心城区26公里，距杭州国际机场13公里，辖12个行政村、10个居委会，总人口近9万，其中户籍人口3.5万。全镇以民营经济为主导，以建筑建材、纺织印染、经编家纺、五金机械为依托，拥有工业总资产193.72亿元，固定资产81.3亿元，现有境内外上市公司4家，国家高新技术企业5家，省级研发中心、企业技术中心4家。2015年实现财政总收入6.93亿元，其中地方财政收入4.34亿元，同比增长7%；工业总产值268亿元，同比增长7.1%；完成工业销售264亿元，同比增长7.2%；完成工业投入6.9亿元；完成自营出口2.41亿美元。位居浙江省省级中心镇前列，位列全省70个百亿级工业强镇11位，柯桥区首位，目前正在打造特色小镇“智汇小镇”。
福全镇
代码：33062103邮编：312046
位于柯桥区西南部，距柯桥城区11公里，104国道南复线穿境而过，素有“金三角”之美称。全镇总面积39.8平方公里，其中耕地面积20400亩，水域面积4800亩，山林面积13000亩；户籍人口4.2万人，登记流动人口3万人，辖22个行政村和2个居委会；设有党组织67个，中共党员2531人。福全是浙江省第二批省级中心镇、省经济百强镇、绍兴市中小城市培育试点镇。
安昌镇
代码：330621106邮编：312080
位于柯桥区西北部，与杭州萧山区毗邻，紧邻杭甬高速公路，距离萧山机场10公里，是杭甬高速公路柯桥道口出口处所在地，全镇面积18平方公里，辖12个行政村(居)、1个集镇社区，常住人口3.65万人，外来人口6.5万人，是中国历史文化名镇、CCTV中国魅力名镇、中国师爷文化之乡、浙江省经济百强镇，安昌古镇是浙东著名的水乡古镇,国家AAA级旅游景区。
兰亭镇
代码：330621108邮编：312045
位于绍兴西南郊，镇域面积83平方公里，辖20个行政村，1个社区居委会，户籍人口3.2万，流动人口2.6万人，31省道（绍大线）和建设中的杭绍台高速贯穿全境，绍诸高速在兰亭设有出口。境内有“兰亭风景区”、“兰亭国家森林公园”、“印山越国王陵”、“王阳明墓”、“徐渭墓”等名胜古迹，是“浙江省级中心镇”、“浙江省特色小镇培育镇”、“绍兴市小城市培育试点镇”，先后荣获“全国环境优美乡镇”、“中国针织名镇”、“中国竹笋之乡”等荣誉称号，目前正在打造培育浙江省特色小镇“书法小镇”。
夏履镇
代码：330621114邮编：312026
位于柯桥区西北部。距省会杭州35公里，绍兴市区32公里，柯桥城区12公里。镇域总面积52平方公里，辖11个行政村，一个居委会，户籍人口1.88万人，森林覆盖率达83.1%，1997年被联合国环境署命名为生态环境“全球500佳”，是全国文明镇，全国环境优美镇，全国非织造布名镇，春秋霸主越王句践“十年生聚十年教训”，曾在此地练兵复国，留有“越王峥”等古迹。
漓渚镇
代码：330621111邮编：312039
位于渚山之麓，鉴水之源，东临福全镇，南连兰亭镇，西接诸暨市店口镇，北与湖塘街道、福全镇仅一山之隔，距绍兴市区约12公里，离柯桥18公里。全镇镇域面积36.6平方公里，辖12个行政村、1个居委会，总人口3.4万人，其中户籍人口2.2万人。花卉苗木、针织家庭工业是漓渚的二大特色经济，先后被命名为“中国花木之乡”和“中国针织名镇”，有“漓渚满目绿无涯，棠棣无处不逢”之说，目前正在打造特色小镇“花木小镇”。
王坛镇
代码：330621107邮编：312055
位于柯桥区南部山区，地处小舜江源头保护区域，汇入小舜江的南北二溪环绕集镇而过，被称为“清水摇篮，养生福地”。全镇地域面积137平方公里，下辖24个村和1个居委会，总计人口3.3万人，先后获得中国环境优美乡镇、中国青梅之乡、浙江省养生福地特别推荐地区、省级旅游强镇、省级体育强镇、省级文化强镇、省兴林富民示范镇、省级生态镇、省级卫生镇等荣誉，镇内有舜王庙、五百岗、香雪梅海、舜湖探源、青陶峡谷、陶隐岭古道、深山竹海、生态山村、茶园风情、南溪江景等“王坛十景”，目前正在打造“醉梅王坛”特色小镇。
稽东镇
代码：330621109邮编：312061
位于柯桥区南部，距城区47公里，与嵊州市、诸暨市接壤，镇域面积111.4平方公里，2003年5月，行政村规模调整后辖24个行政村，1个居委会，总人口3.5万人，其中农业人口3.3万人。稽东山水秀丽、民风淳朴、特产丰富、文化深厚，是“浙江省十大特色乡镇”、“全国环境优美镇”、“中国香榧之乡”，目前正在打造特色小镇“时光小镇”。