运费税款账务处理：
由于营改增以后，托运方支付运费后，可能取得的发票是《货运业增值税专用发票》或者增值税普通发票。
如果取得的是货运业增值税专用发票，跟取得的其它形式的增值税专用发票一样，根据票面载明的金额确认运费、根据票面载明的增值税确认进项税。
会计处理为：
Dr：应交税费——应缴增值税（进项税） 票面载明的税金
原材料/管理费用/销售费用 票面载明的运费
Cr：银行存款 发票票面的价税合计金额
税务处理为：根据票面载明的税金确认增值税进项税；根据票面载明的运费，根据运费的归属对象确认原材料/管理费用/销售费用。
一般纳税人运输发票税率是11%。《财政部国家税务总局关于将铁路运输和邮政业纳入营业税改征增值税试点的通知》(财税[2013]106号):附件1:《营业税改征增值税试点实施办法》第十二条增值税税率:(一)提供有形动产租赁服务，税率为17%。(二)提供交通运输业服务、邮政业服务，税率为11%。(三)提供现代服务业服务(有形动产租赁服务除外)，税率为6%。(四)财政部和国家税务总局规定的应税服务，税率为零。第十三条增值税征收率为3%。