直营的快递公司主要为顺丰。直营店，是指由总公司直接经营的连锁店，即由公司总部直接经营、投资、管理各个零售门店的经营形态。总部采取纵深式的管理方式，直接下令掌管所有的零售门店，零售门店也必须完全接受总部指挥。直营店的主要特点是，所有权和经营权集中统一于总部。所有成员企业必须是单一所有者，归一个公司、一个联合组织或单一个人所有，由总部集中领导、统一管理，如人事、采购、计划、广告、会计和经营方针都集中统一。实行统一核算制度，各直营店实行标准化经营管理。该模式的优点在于，可以统一调动资金，统一经营战略，统一开发和运用整体性事业；在人才培养使用、新技术产品开发推广、信息和管理现代化等方面，易于发挥整体优势。该模式的缺点在于，各成员店自主权小，积极性、创造性和主动性受到限制。
加盟模式的快递公司比较多，如中通、申通等。加盟店，是指企业组织将其服务标章授权给加盟店主，让加盟店主可以用加盟总部的形象、品牌、声誉等在商业消费市场上招揽消费者。加盟店主在创业之前，加盟总部会先将本身的经验教授给加盟店主并协助其创业与经营，双方须签订加盟合约，加盟总部可因不同的加盟性质向加盟店主收取加盟金、保证金以及权利金等。加盟店的主要特点是，加盟总部仅提供必要的形象、品牌、培训和管理等支持，各加盟店独立运营、独立承担法律责任。其优点在于，各加盟店的灵活性、主动性和自主性较强。其缺点在于，各加盟店容易各自为阵，缺乏团队合作精神，不便于统一管理、统一运营。
两者的对比
序
号 对比内容 直营快递 加盟连锁式快递
1 投资者 1-5个 1、2、3-N个
2 利润中心 1个 1、2、3-N个
3 管理方式 以执行指令为主 以协调为主
4 管理效率 高 低
5 操作标准执行 好 差
6 管理者素质 普遍较高 参差不齐
7 销售价格体系 较统一 不统一（视当地情况）
8 成本低核算单位 统一 1、2、3-N个
9 派送范围大 按照快件量决定 较广
10 成本费用率 综合管理成本高 操作成本低，协调成本高
11 市场定位 低中高端 低端
12 销售技巧 多元化 单一
13 培训体系 具有完善的培训体系 未形成完善的培训体系
14 企业文化 较成熟，认同度高 不成熟，认同度低
15 执行力 较强 较弱
16 经营动机 以长期发展为主 以短期盈利为主
17 子公司间关系 依靠管理系统 依靠管理者个人素质
18 恶性事件发生概率 极少 较频繁
19 经营风险 承担子公司的连带责任 个体违规造成普遍损失较大
20 销售渠道 以专职销售为主 以递送员为主
21 竞争手段 综合保证服务水平 低价格，佣金为主
22 IT系统应用 普遍应用较好 参差不齐
先进快递企业经营模式
快递服务延伸模式——是指在现有快递服务的基础上，通过向两端延伸，向客户提供更加完善和全面的快递服务，从而提高快递服务的附加价值，满足客户高层次快递需求的经营模式。如，仓储企业利用掌握的货源，通过购买部分车辆或者整合社会车辆从事配送服务；运输企业在完成货物的线路运输之后，根据客户的要求从事货物的临时保管和配送。这种模式对于从事单一功能快递服务的传统快递企业来说，不仅可以拓展快递服务的范围，而且达到提高快递服务层次的目的。
行业快递服务模式——是通过运用现代技术手段和专业化的经营管理方式，在拥有丰富目标行业经验和对客户需求深度理解的基础上，在某一行业领域内，提供全程或部分专业化快递服务的模式。这种经营模式主要特点是将快递服务的对象分为几个特定的行业领域，然后对这个行业进行深入细致的研究，掌握该行业的快递运作特性，提供具有特色的专业服务。 项目快递服务模式——是指为具体的项目提供全程快递服务的模式。这类需求主要集中在我国一些重大的基础设施建设项目和综合性的展会、运动会中，如三峡水电站、秦山核电站、国家体育馆等基建项目以及奥运会、展览会等大宗商品的运输快递服务，实施这种模式的快递企业必须具备丰富的快递运作经验和强大的企业实力。
定制快递服务是指将快递服务具体到某个客户，为该客户提供从原材料采购到产成品销售过程中各个环节的全程快递服务模式，涉及到储存、运输、加工、包装、配送、咨询等全部业务，甚至还包括订单管理、库存管理、供应商协调等在内的其他服务。现代快递服务强调与客户建立战略协作伙伴关系，采用定制式服务模式不仅能保证快递企业有稳定的业务，而且能节省企业的运作成本。快递企业可以根据客户的实际情况，为其确定最合适的快递运作方案，以最低的成本提供高效的服务。 快递咨询服务模式是指利用专业人才优势，深入到企业内部，为其提供市场调查分析，快递系统规划、成本控制、企业流程再造等相关服务的经营模式。企业在为客户提供快递咨询服务的同时，帮助企业整合业务流程与供应链上下游关系，进而提供全套的快递解决方案。企业通过快递咨询带动其他快递服务的销售，区别于一般仓储、运输企业的简单化服务，有助于增强企业的竞争力。 快递管理输出模式是指快递企业在拓展国内企业市场时，强调自己为客户企业提供快递管理与运作的技术指导，由快递企业接管客户企业的快递设施或者成立合资公司承担快递具体运作任务的服务模式。
快递连锁经营是指特许者将自己所拥有的商标（包括服务商标）、商号、产品、专利和专有技术、经营方式等以特许经营合同的形式授予被特许者使用；被特许者按合同的规定，在特许者统一的业务模式下从事经营活动，并向特许者支付相应费用的快递经营形式。 快递联盟模式是指快递企业为了达到比单独从事快递服务更好的效果，相互之间形成互相信任、共担风险、共享收益的快递伙伴关系的经营模式。国内快递企业，尤其是中小型民营企业的自身力量薄弱，难以与大型跨国快递企业竞争，因此，中小型快递企业的发展方向是相互之间的横向或纵向联盟