电子存根一般指物流行业的电子运单，即将货运单抛弃传统的八联纸质运单的形式，而以一份电子数据的形式存在信息系统中，类似‘E-TICKET’，即电子客票，是实现电子物流的重要标志。
它使航空货运的业务操作转变到对信息的审核和利用上来，通过计算机系统信息检索、转换、传输以及分析的强项，高效率地实现传统纸质运单的功能，而省去纸质运单操作的种种不便。
电子运单具有操作便捷、数据准确、绿色环保等优点和功能，不仅能够提高运输公司的服务质量，更是能为运输公司、海关联检和代理企业节约不少成本，也符合节能减排政策。同时，更为航空货运进入互联网时代奠定了一定的技术基础。
应用：
快递速运行业虽然先行一步，由于缺乏统一协调和促进，现在只有PARCEL FORCE，DHL,FEDEX,TNT,TOE等几家公司在推进电子运单，而中国国内快递中，尚未有任何公司开展电子运单项目，在业务层面领先的EMS和顺丰也仅仅是提交简单的在线发件而已。因此每年预计由于使用有纸的传统运单而消耗近亿人民币。
以上内容参考：-电子运单