北部湾经济区的功能是：立足北部湾，服务“三南”（西南，华南和中南），沟通三个地区，面向东南亚，充分发挥多渠道的重要领域连接，通信和协作平台为桥梁，以开放的发展，合作建设，努力打造中国 - 物流基地东盟开放合作，商贸基地，制造基地和信息交流中心，一个驱动器，支持战略的高度，高度地面和开放的西部大开发，辐射力强，经济繁荣，社会和谐，生态良好的重要国际区域经济合作区。
根据空间布局和岸线分区，规划建设五个功能组。
中国广西南宁旅游。包括南宁市区及周边重点发展中心城市的资本发挥作用，着眼于高新技术产业，加工制造业，商业和金融，会展，物流等现代服务业，建设保税物流中心的发展，成为中国与东盟的区域性国际城市的合作，综合交通枢纽和信息交流中心。
中国钦（州）防（城港）组。包括钦州，防城港市区和海滨工业区及沿海相关地区，发挥深水大港优势，建设保税港区，重化工业和港口物流的海滨发展，成为利用两个市场，两个生产基地和物流基地的资源。
中国北海旅游。包括北海，合浦县城区及周边重点开发区，发挥亚热带滨海旅游资源，滨海旅游和跨国旅游业的发展，重点发展电子信息，生物制药，海洋开发等高技术产业和出口的发展加工业，拓展出口加工区保税物流功能，保护良好的生态环境，优美的生活环境舒适的海滨城市。
中国铁山港（龙）组。铁山港区包括北海，玉林市龙潭镇，充分发挥深水岸线，靠近广东的区位优势，重点建设铁山港量较大的泊位和深水航道，承接产业转移，基于端口的产业的发展，建设海峡两岸（玉林）农业合作试验区。
中国东兴（凭祥）组。包括东兴防城港，崇左凭祥市边境经济合作区及周边重点开发，海陆东盟发挥大通道通往出口的发展网关的作用边境加工，商贸物流和边境旅游，拓展凭祥经济技术合作区，建立凭祥边境综合保税区。
中国国家支持北部湾经济区的开放开发，明确给予政策支持五个方面：
中国（a）是一个综合政策支持配套改革。国家支持推广的行政管理体制，市场体系，土地管理制度的全面改革。
中国（B）是支持重大项目方面的政策。国家在规划，重大项目及项目审批，核准，备案和支持等方面。
中国（iii）在保税物流体系方面的政策支持。对于符合保税港区的条件成立的北部湾经济区的国家支持，综合保税区和保税物流中心，拓展出口加工区，保税物流等功能。
中国（D）是在金融改革方面的政策支持。建立北部湾地区一家本地银行的国家支持，探索建立产业投资基金和风险投资公司，以扩大企业债券发行规模，支持符合条件的企业发行企业债券。
中国（五）在开放合作方面的政策支持。国家支持北部湾经济区开放合作发挥示范作用，推动泛北部湾经济合作已成为中国 - 东盟合作框架下新的次区域合作，建立和完善开放合作机制，加快实施合作项目。
物流中心的一项重要的工作，就是帮助企业解决境外游难题。南宁国际综合物流园有限公司就驻扎在南宁保税物流中心内，该公司负责人向记者深入浅出地介绍了何为境外游。
比如说，对于外向型来料加工企业，原料是国外进来的，市场也在国外，正常的时候没什么，但假如国外市场不好或者别的什么原因导致这些产品需要在国内销售，那么这些产品就必须出一次境外在回来报关一次才能在国内销售，这个过程就叫做境外游，因南宁企业多选择香港作为出境，所以也戏称为香港一日游。
保税物流中心就如同一个境内关外,企业只要入内转一圈,就完成了出境和回来报关这个过程，为企业省下了原来境外游的环节和花费.
举一个简单的例子，在南宁市一个大集装箱的产品假如要进行一次境外游，那么他的路径将是这样的。
没有南宁保税物流中心的情况：南宁拖车到防城港（2500元左右），通过海运到香港（400美元左右），然后再从香港回来到深圳报关检验（3000到4000元再加上各种税费），完成一次境外游可以在国内销售。
通过南宁保税物流中心的情况：拖车到南宁保税物流中心经过海关检验，缴纳相关税费就可以完成一次境外游，运费加上搬运等费用1000元左右。