物流信息系统是一个以个人为主导，利用计算机硬件、软件、网络通信设备以及其他办公设备，进行物流信息的收集、传输、加工、储存、更新和维护，以物流企业提高效益和效率为目的，支持物流企业高层决策、中层控制、基层运作的集成化的人机系统。它的基本功能可以归纳为以下几个方面：
1·数据的收集和录入。物流数据的收集首先是将数据通过收集子系统从系统内部或者外部收集到预处理系统中，并整理成为系统要求的格式和形式，然后再通过输入子系统输入到物流信息系统中。这一基本功能是其他功能发挥作用的前提和基础。
2·信息的存储。物流数据进入到系统中之后，经过整理和加工，成为支持物流系统运行的物流信息，这些信息需要暂时存储和永久保存以供使用。物流信息系统的存储功能就是保证已得到的后勤信息能够不丢失、不走样、不外泄、整理得当、随时可用。无论哪一种物流信息系统，声涉及信息的存储问题时，都要考虑存储量、信息格式、存储方式、使用方式、存储时间、安全保密等问题。数据的存储必须要考虑数据的组织，目的是为了数据的处理和检索。
3·信息的传输。物流数据和信息在物流系统中，必须及时、准确传输到各个职能环节，龙能发挥其功效，这就需要物流信息系统具有克服空间障碍的功能。物流信息系统必须要充分考虑所要传递的信息种类、数量、频率、可靠性要求等因素。
4·信息的处理。物流信息系统的最基本目标，就是将输入数据加工处理成物流信息。信息处理可以是简单的查询、排序，也可以是复杂的模型求解和预测，信息处理能力是衡量物流信息系统能力的一个极其重要的方面。所谓物流数据是指不能直接满足物流作业系统某一环节的需要，但又与之密切相关，只要通过一系列的信息处理就可以满足需要的物流情报。而那些能够直接或者经过信息处理后能够在某一作业环节上发挥功能的物流情报，就称为物流信息。
5．信息的输出。物流信息系统的目的是为各级物流人员提供信息。为了便于人员理解，系统输出的形式应力求易读易懂、直观醒目，这是评价物流信息系统的主要标准之一。