明清时期
本区域行政区划，明以前无考。明清设里甲制度，甲以下设团、甲、牌三级，民国《万县志》记述“甲大者两分之，曰前后某甲，甲之长谓之团总。视甲之大小设团若干，置团首。团以下十家为牌，牌有首，十牌为甲，甲有长”。这一时期大二甲辖分水、黄泥、大兴、三元、王家、瑞池6个场，设团若干。
民国时期
1927年，国民政府改行政管理体制，甲改乡镇，甲以下实行保甲制度，即改团为保，大二甲改为黄泥乡，设保50个。
1929年推行城乡自治后成立的第二区辖龙凤乡等10个乡镇。
1929年由黄泥乡析出部分保设立培文乡、三元乡。
1931年撤销培文乡、三元乡、黄泥乡，并入大二镇。
1935年改设第三区，乡镇改为联保，辖12个联保。
1938年改联保为乡镇，培文乡与三元乡合并，辖10个乡镇，
1941年调整乡镇建制，辖14个乡镇，此后直到民国38年没有大的变化。
解放以后
1949年12月建立高升区，辖培文乡、三元乡、孙家乡、分水乡、三正乡、高梁乡、石马乡、五梁乡、顺溪乡、高升乡10乡。
1950年3月置分水区，辖培文乡、孙家乡、分水乡、三元乡4乡。1951年1月改分水区为五区，划出三元乡至14区，划入三正乡，辖三正、分水、培文、孙家4个乡，71个保（其中三正乡19个保，分水乡15个保，培文乡19个保，孙家乡18个保）。
1951年后，废除保甲制，建立村政权，71个保全部改为行政村。
1952年9月划出孙家乡（见《万县组织史》），辖三正、分水、培文三乡。
1953年行政区划大调整，1月，从分水析出龙门村建立分水镇，辖2个段1个村；从培文乡析出青云山、铧头嘴、袁家山、大兴场、楠木寺、金狮岭等6个村成立兴安乡。2月，响水乡高兴村（原响水乡13保）3个队划归分水，后设五马村；响水乡付家村（此前为八胜宫村）并入石杠村划归分水乡管辖；甘宁乡三角村划归分水乡，分水乡石杠、石梯2村划入新成立的易家乡归第14区管辖。6月，从三正乡析出四方、兰花、红椿、杨柳、新屋、新民等6个村建立枣园乡；从分水乡析出石燕、黄泥、礼福、白果、红豆、凤凰、清坪等7个村建立黄泥乡；从培文乡析出龚家山、八角、向庙等5个村成立向庙乡；从三正乡析出上石孔、下石孔、石龙、白果、麻柳，分水乡析出五马、智德等村组建新石乡。
1953年7月后，分水区管辖三正、分水、培文、新石、枣园、黄泥、向庙、兴安、分水镇等9个乡镇。
1955年12月恢复五区为分水区、撤销8个小乡，恢复为三正、分水、培文3乡（其中新石乡的智德、五马划归分水乡，其余村划入三正乡；黄泥乡所辖村分别并入分水、三元、易家乡）；保留分水镇，改辖3个段，1个村；划入高升乡、石马乡、三元乡（此前，1953年7月划出易家、瑞池、笔峰、三更、小弯、双河、新村等7个村组建了瑞池乡）、易家乡、孙家乡。被撤销的高石乡（1953年11月成立，办公地点望月岭）的回龙村（后与中坝村合并）划入分水乡；被撤销的大梁乡（1953年1月成立，办公地点新屋院子）的永角、王兴2村划入三正乡；甘宁乡辣子坪村与高升乡小城村1队合并为辣子村划归三正乡管辖；被撤销的高洞乡（1953年1月成立）的茶坪、牟家2村划入三正乡；三元乡的红豆村划归分水乡。被撤销的新石乡的五马村与高兴村合并成立新的五马村。全区辖乡镇9个，行政村72个，农业生产合作社364个。
1956年6月，撤销易家乡，其石杠、中坝两村划归分水乡管辖。1958年搞人民公社，11月改乡为公社，适当合并或改村为管理区队。全区辖公社7个，镇1个，共设区队152个。
1961年4月划出石马公社。改公社管理的区队为生产大队，并新增设组建了双丰、红寨、五马、砂坪、青龙、楠木寺等生产大队。4月，从高升公社中析出荆竹、杨见、蒲团、帽合等4个生产大队，并将杨见分出毛坝，蒲团分出白羊、荆竹分出双河共7个生产大队，复置毛坝公社；从三正公社中分出四方、兰花、新民、新屋、茶坪、牟家、永角、王兴等8个生产大队并将茶坪分出砂坪，永角分出青龙共10个生产大队复置枣园公社。7月，从分水公社析出礼福、三角等生产大队复置黄泥公社。12月，从培文公社析出大兴场、金狮岭、袁家山3个生产大队并将大兴场分出楠木、青云山共5个生产大队成立大兴公社。全区辖10个公社1个镇，106个生产大队，804个生产队。
1966年11月，全区5个公社在“破四旧”时期更名，高升改为光辉、枣园改为红花、培文改为文武、三元改为灯塔、孙家改为太阳，同时43个生产大队也更名。
1975年11月全部恢复原名。1979年培文公社红古大队划出花果园大队，全区增划53个生产队，1980年再次增划190个生产队。
1981年地名普查毛坝公社更名为茅坪公社，另有38个大队更名，分水镇3个居民小组组建成1个社区，全区辖10个公社1个镇，107个大队，1个社区，1047个生产队。
1984年4月，全区公社改为乡。7月，分水乡并入分水镇，直到1992年未有变动，全区辖9乡1镇，107个村，1个社区。
1992年10月，分水区建制撤销，辖区合并组建了三正镇、培文镇、分水镇、这一时期辖区有3个镇，72个村，6个社区，775个村民小组。
1998年11月，分水镇析出三角、石梯、金凤、红寨、杉林、石杠、礼福、白果、红豆、清坪等10个村和黄泥社区设立黄泥乡。培文镇析出邓家、梨子、高楼、张家山、大冲、老观、石硖、花屋、油寨等9个村和三元社区设立三元乡；析出楠木寺、大兴、金狮岭、青云山、袁家山等5个村设立大兴乡。1998年12月，经原万州区天城管委会批准，撤销分水镇下坝村、双丰村，建立敬家河、双丰、下坝3个社区。这一时期辖区有3乡3镇，70个村，9个社区，732个村民（居民）小组。
2004年9月，三正镇、分水镇、培文镇、黄泥乡、三元乡、大兴乡合并组建成分水镇。10月，调整村居规模，合并村、居民小组。
2005年12月，分水镇辖分水岭社区、三正埠社区、张家嘴社区三个社区和石碾村、大地村、五马村、川心村、竹山村、双红村、辣子村、四方村、枣园村、茶坪村、王兴村、黄泥村、三角村、红豆村、培文村、郎家村、龚家湾村、八角村、红古村、大冲村、三元村、花屋村、大兴村等23个村，198个村民小组，27个居民小组。 分水镇地处渝东平行岭谷区与山地过渡地带，地貌以丘陵为主，四周山峦重叠，深丘峡谷纵横，地质复杂，地形多样，海拔在200～850米之间。
地貌
境内地质复杂，地貌多样，以低山、丘陵为主，次为低中山。全境最高点为北部悦君山马鬃岭，海拔1373米；最低点为西南部的王场河沟，海拔240米，境内相对高差1133米。全境低山、丘陵面积约占三分之二，低中山和山间平地面积约占五分之一，极少的平坝和台地零星散布。
地质
境内地质构造线属于新华夏系第三巨型隆起带武陵山褶皱带西缘与大巴山弧形褶皱带控制的四川菱形构造盆地的北东三角区一隅。多为小褶皱，呈雁形排列，纽状起伏。其褶皱以铁峰山背斜和万县向斜为主。铁峰山背斜在白庙入境，境内全长10公里，地层为三叠纪须家河组和中、下侏罗纪。万县向斜核心地层为上侏罗纪，由东北向西南在红古村陈明岩进入忠县境。
山脉
境内北部为铁峰山脉，约呈东西走向，在境内东起于荆竹沟，西止于白庙梁，长约10公里，宽约3.5公里。在境内称为悦君山（地名办确认）。