淘宝申请退款填写运单号正确但系统提示运单号有误的原因是用户填写了正确的运单单号，但选择了错误的快递公司。
快递物流信息由两部分组成，分别是快递公司名称和快递单号。每家快递公司的快递单号都是不一样的，因此，只有快递公司和快递单号同时对上了，才能输入正确的物流信息。
如果快递单号填对了，但快递公司名称填错了，则视为运单号有误而导致无法发货的。
扩展资料：
退货后如果快递单号填错，运费险一样是会理赔的。物流单是运费险理赔的重要依据，若您在运费险申请理赔时已提交物流单号，但不小心填错了，请您先不用担心，保险公司会在卖家确认收货退款成功的72小时内进行审理，建议您在卖家确认收货退款成功72小时后关注审核结果。
如果后续结果为审核失败，可以提供正确物流单号核实处理。
参考资料：
淘宝网-退货快递单号填写错了，如何修改？