截至2008年，日内瓦国际机场共连接104个城市，其中80个为欧洲城市[1]。部分航线为季节性，特别是冬季。
爱尔兰航空（贝尔法斯特、科克、柏林）
俄罗斯航空（莫斯科-舍列梅季耶夫国际机场）阿尔及利亚航空（阿尔及尔、康斯坦丁、奥兰）
加拿大航空（蒙特利尔、多伦多-Pearson）[6月2日起][2]
法国航空（巴黎-戴高乐机场）
法国航空 CityJet代理（伦敦）
法国航空 Régional代理（阿雅克肖、Biarritz）
马耳他航空 (Catania, Malta-Luqa)
毛里求斯航空（毛里求斯）
意大利航空（罗马-Fiumicino）
Air One（罗马-Fiumicino）[3月29日起] [3]
Atlas Blue（马拉喀什）
奥地利航空（维也纳）
Blue Islands（Guernsey, Jersey, 南安普敦）
bmibaby (伯明翰、加迪夫、East Midlands、曼彻斯特）
英国航空（伦敦-Gatwick [季节性]，伦敦-希思罗机场）
BA CityFlyer代理（伦敦）
布鲁塞尔航空（布鲁塞尔）
美国大陆航空（纽瓦克 (新泽西州)|纽瓦克）
达尔文航空（Cagliari [季节性]、卢加诺、Olbia [季节性]）
easyJet（阿雅克肖[季节性]、阿利坎特、阿姆斯特丹、Asturias，巴塞罗那、巴斯蒂亚[七月开始[4]]、贝尔法斯特-International [季节性]、柏林-Schönefeld、伯明翰[季节性]、波尔多、伯恩茅斯[季节性]，布里斯托尔、布鲁塞尔、布达佩斯、Cagliari [季节性]、杜布罗夫尼克[七月开始[5]]、East Midlands、爱丁堡、格拉斯哥-International [季节性]、伊维萨岛[季节性]、拉斯帕尔马斯、里斯本、利物浦、伦敦-Gatwick、伦敦-Luton、伦敦-Stansted [季节性]、马德里、马拉加、曼彻斯特、马拉喀什、南特、那不勒斯[季节性]、纽卡斯尔[季节性]、尼斯、奥尔比亚[季节性]，帕尔马、巴黎-Orly、波尔图、罗马-Ciampino、斯普利特[季节性]、斯德哥尔摩-Arlanda）
埃及航空（开罗、古尔代盖、沙姆沙伊赫）
以色列航空公司（特拉维夫）
瑞士雪绒花航空（古尔代盖、Kos，拉斯帕尔马斯、沙姆沙伊赫、特内里费岛-South）
阿联酋联合航空（阿布扎比）
芬兰航空（赫尔辛基）
Flybaboo（雅典、Biarritz、波尔多、Bucharest-Otopeni、弗洛伦萨、Ibiza, 卢加诺、那不勒斯、尼斯、普里什蒂纳、罗马-Fiumicino、圣特罗佩、索菲亚、图卢兹、巴伦西亚、威尼斯、维也纳、Zagreb）
Flybe（Exeter, Isle Of Man, Jersey, Newquay, 诺维奇、南安普敦）
Flyglobespan（爱丁堡）
Hello航空（普里什蒂纳）
西班牙国家航空（马德里）
伊朗航空（德黑兰-Imam Khomeini）
Jet2com（利兹/布拉德福德）
Jet4you（卡萨布兰卡）
荷兰皇家航空（阿姆斯特丹）
科威特航空（科威特城、巴黎-戴高乐机场）
LOT波兰航空（华沙）
德国汉莎航空（法兰克福）
汉莎区域航空，Air Dolomiti代理（慕尼黑）
汉莎区域航空，Augsburg Airways代理（慕尼黑）
汉莎区域航空，Eurowings代理（杜塞尔多夫）
汉莎区域航空，由Lufthansa CityLine代理（杜塞尔多夫、汉堡、慕尼黑）
卢森堡航空（卢森堡）
匈牙利航空（布达佩斯）
中东航空（贝鲁特）
挪威航空（奥斯陆）
卡塔尔航空（多哈）
Rossiya航空（圣彼得堡，季节性）
皇家摩洛哥航空（卡萨布兰卡）
皇家约旦航空（安曼）
沙特阿拉伯航空（吉达、曼彻斯特、Riyadh）
北欧航空（哥本哈根、斯德哥尔摩-Arlanda）
瑞士国际航空（雅典、巴塞罗那、布加勒斯特-Otopeni、布达佩斯、伊斯坦布尔-Atatürk、莫斯科-Domodedovo、纽约-JFK、普里什蒂纳[5月16日起[4]]、苏黎世）
Swiss European Air Lines（伦敦-City，马拉加、曼彻斯特、布拉格、巴伦西亚、苏黎世）
TAP葡萄牙航空（里斯本、波尔图）
Thomsonfly（唐克斯特-Sheffield）
荷兰Transavia航空（鹿特丹）
突尼斯航空（吉尔巴岛、Monastir，突尼斯）
土耳其航空（伊斯坦布尔-Atatürk）
联合航空（华盛顿-Dulles）[4月20日起][6]
乌兹别克斯坦航空（塔什干）
维京航空（伦敦-Gatwick、曼彻斯特）