综合实力来讲南京栖霞高中更好。
1、教师队伍：
南京市栖霞学校有专任教师中、高级职称57人，有区级以上名优骨干称号教师85人，其中有正高级（教授级）教师3人，江苏省特级教师2人；大市学科带头人14人、区学科带头人16人。
南京市玄武高级中学校区高中部有玄高区级以上骨干教师共73人，玄武区学科带头人22人，南京市优秀青年教师12人，南京市学科带头人6人。
2、硬件设施和软件环境：
南京栖霞学校经历八十余年的发展旅程，既有浓厚的文化积淀，为高等院校和地方建设培养和输送了大量的人才，又具现代化的办学条件和办学理念，学校理、化、生实验条件达到四星级高中标准。
南京玄武高级中学宿舍条件学校住宿配套设施齐备，有空调与淋浴房，学校有可供1000人集中就餐的学生食堂，供应三餐。南京玄武高级中学设施先进，配备完善学校建有现代化体育馆。
3、好的学生生源：
南京栖霞高中的升学率为85%，在大部分学校之间位于前列。
玄武高中自2023年起纳入一批次招生，近几年玄高分数线都是超一批次线的，去年分数线为563分，但相较于南京栖霞高中还是略微低一些。
4、管理程度：
南京栖霞中学不断探索办学新思路，高度重视教育研究和考试研究，教育成果显著，高考成果连年提高，已连续三年获栖霞区教育局“教育教学成果一等奖”，栖霞中学校风为团结、务实、勤奋、文明，栖霞中学教风为严谨、勤恳、求真、务实。
玄武区学校教育教学成绩非常突出，受到市里隆重表彰。其中九中、十三中继续囊括规范办学奖、素质教育奖、内涵发展奖、质量优秀奖、突出贡献奖等奖，玄武区4所高中教育教学经验交流材料也均被收录在“大会交流材料汇编内”。