1997年，富顺县辖28个镇、17个乡：城关镇、邓井关镇、东湖镇、琵琶镇、黄葛镇、狮市镇、骑龙镇、代寺镇、中石镇、童寺镇、古佛镇、赵化镇、万寿镇、安溪镇、怀德镇、长滩镇、永年镇、兜山镇、彭庙镇、板桥镇、李桥镇、福善镇、瓦市镇、仙市镇、互助镇、牛佛镇、庙坝镇、回龙镇、起凤乡、新兴乡、王大山乡、洪沟乡、富和乡、大城乡、石道乡、飞龙乡、新农乡、毛桥乡、宝庆乡、芝溪乡、万坳乡、龙硐乡、李子铺乡、柑坳乡、永胜乡。
1998年，富顺县辖8个区、28个镇、17个乡。富顺县设牛佛、瓦市、永年、板桥、童寺、代寺、赵化、怀德8个区公所，辖城关、邓井关、安溪、童寺、代寺、永年、怀德、赵化、牛佛、东湖、黄葛、琵琶、狮市、骑龙、庙坝、回龙、瓦市、仙市、互助、彭庙、兜山、板桥、福善、李桥、万寿、长滩、古佛、中石28个镇和永胜、王大山、洪沟、新兴、起凤、富和、毛桥、新农、飞龙、大城、石道、宝庆、芝溪、龙硐、万坳、柑坳、李子铺17个乡。县政府驻城关镇。
2001年，撤区并镇，全县辖27个镇、4个乡。辖富世、牛佛、怀德、代寺、琵琶、狮市、骑龙、板桥、福善、李桥、赵化、安溪、庙坝、回龙、瓦市、万寿、古佛、中石、永年、童寺、东湖、仙市、互助、彭庙、兜山、长滩、飞龙27个镇和富和、石道、宝庆、龙万4个乡，共有589个行政村。
2005年7月，自贡市区划调整，县域庙坝、牛佛、回龙镇划归大安区管辖，瓦市、仙市镇划归沿滩区管辖。全县辖22个镇、4个乡，幅员由1603平方公里减为1336平方公里。 江河小溪 县境内河流属沱江水系，沱江由北向南纵贯县境，总共有大小溪河351条，其中长50千米以上，流域面积在100平方千米以上的有3条，长10千米以上，流域面积在30平方千米以上24条。
沱江干流富顺河段：境内流长87千米，总水面32平方千米。年平均流量400立方米/秒左右，年径流总量129.3亿立方米，最大峰量15200立方米/秒，最小流量6.72立方米/秒。
釜溪河：沱江一级支流，建国前自贡食盐运输之通道，故又称盐井河。源于旭水河、威远河，在自流井凤凰坝汇合后，名釜溪河。该河经自贡市南折由互助镇力和村入县境，在永年镇李家湾汇入沱江，全长73.3千米，县境内长32千米，天然落差19.1米，平均比降0.27‰，河道迂回曲折，沿江多系低山浅丘，河谷开阔，岸边多台地，比降平缓极易受沱江洪水倒灌。
镇溪河：是釜溪河一级支流，源于自贡市沿滩区仲权镇铁匠湾，由自贡、宜宾、富顺边界流经合水桥、富全乡黑水凼，入宜宾孔滩、草堂、王场乡进入本县富和乡，流入木桥沟水库后，在李家湾镇溪口注入釜溪河，再下流400米处汇入沱江。全长75千米，境内长60.5千米，流域面积433平方千米，多年平均天然流量6.12立方米/秒，是县城饮水水源。
大城河：源于中石乡新桥水库，主干流经古佛乡、童寺镇芝溪、宝庆乡至大城虎头寨右侧注入沱江，全长33千米，集雨面积122.93平方千米，河面平均宽度50米，年水量4919.6万立方米，天然落差108.6米，河床平均比降3.27‰。主要用于灌溉，借河床落差下游纳塔洞、大城老堰等地可修建小水电站。
石灰溪：在沱江右岸，源于南溪县北殷家滩，由安溪镇毛桥入本县境，流至安溪镇幺灏陈家湾与南溪北部流来之石灰溪汇合，在安溪镇场口马鞍石注入沱江，全长26.8千米，境内长12千米，河面平均宽17.5米，集雨面积29.6平方千米，年水量473.1立方米。该溪上游建有金银窝水库，有效库容1023立方米。沿溪利用落差曾建4处水轮泵站，并可建小水电站。 地下水 县境内地下水资源不丰富，主要为分布于红层砂、泥岩的孔隙--裂隙水，次为第四系松散堆积层孔隙水。碳酸盐裂隙熔洞水仅在青山岭及梯子崖背斜局部有所分布。地下水一般埋藏深度25至50米。杨初步调查资料，本县地下水储量为0.42亿立方米。