1997年，面积20347平方千米，人口2.5万。辖1镇10乡：扎木镇、古乡、倾多乡、许木乡、八盖乡、玉仁乡、多吉乡、康玉乡、松宗乡、玉普乡、易贡乡。县政府驻扎木镇。
2000年，波密县辖3个镇、8个乡。根据第五次人口普查数据，全县总人口26748人，其中各乡镇人口（人）： 松宗镇 1600人、 倾多镇 4350人、 扎木镇 6651人、 多吉乡 2772人、 玉普乡 1302人、 许木乡 2503人、 玉仁乡 2300人、 康玉乡 1564人、 八盖乡 1344人、 易贡乡 1108人、 古乡 1254人。 波密县辖3个镇、8个乡：扎木镇、倾多镇、松宗镇、古乡、许木乡、八盖乡、玉仁乡、多吉乡、康玉乡、玉普乡、易贡乡。共有89个行政村。县人民政府驻扎木镇。
扎木镇 辖10个村委会：通木村、娘那村、东绕村、达兴村、扎木村、桑登村、巴琼村、岗村、卡达村、康木村。
倾多镇 辖14个村委会：朗秋村、朱西村、巴康村、达龙村、如纳村、扎西村、曲西村、康达村、热西村、叶巴村、古同村、德吉村、松村、顶仲村。
松宗镇 辖9个村委会：角达村、德巴村、岗巴村、多格村、纳玉村、觉通村、龙亚村、朗秋村、格尼村。
古乡 辖7个村委会：古村、嘎朗村、索通村、乔那村、松绕村、雪瓦卡村、巴卡村。
许木乡 辖9个村委会：麦差村、沙仁村、布拉村、南多村、玉沙村、白玉村、林琼村、热西村、棠木村。
八盖乡 辖7个村委会：塔鲁村、卧普村、巴瑞村、木玉村、雄金村、日卡村、龙普村。
玉仁乡 辖7个村委会：则普村、黑定村、扎西岗村、达拉村、麦拉村、德堂村、邦肯村。
多吉乡 辖10个村委会：觉洛村、毛江村、木古村、武巴村、扩拉村、西巴村、达大村、帕雄村、德吉村、通村。
康玉乡 辖5个村委会：同堆村、乌那村、达秋村、宗热村、拉瓦西村。
玉普乡 辖6个村委会：米堆村、米美村、中坝村、阿西村、格巴村、达巴村。
易贡乡 辖5个村委会：贡仲村、格通村、沙玛村通拉村、江拉村。