2006年，该县以蔬菜、油菜为主的经济作物播种面积达到23877.85亩，占总播种面积的20.49%。此外，南木林县在畜牧业和养殖业结构调整方面，根据全县的实际情况，在牧业乡大力发展牦牛，稳定小畜，减少马匹养殖；在半农半牧乡发展山羊，稳定绵羊，控制马匹及驮畜；在农业乡做到大力发展黄牛，稳定小畜养殖，推广养鸡、养猪、养鸭等副业产品，促进了农牧业生产的发展。
2006年，南木林县完成短期育肥49923个绵羊单位，出栏36793个绵羊单位，总收入867.2万元，纯收入581.8万元。2006年，以艾玛土豆为龙头的土豆种植规模扩大到了3.17万亩，比2005年增加0.7万亩，土豆产量达1.84亿斤。试种了200亩脱毒薯。 南木林县以县城商贸设施建设为突破口，完善城市功能，主要规划建设了两个项目：一是建筑面积达2720平方米、投资540万元的人民路商业街开发建设项目，主要包括机关餐厅、商贸楼和商品房项目；二是总投资达136万元的县农畜贸易市场建设项目。
针对县城及县级机关基础设施差的实际，南木林县投资229万多元，改造县级机关及办公楼的旱厕，铺设地下排水管道，安装机关大院路灯，修建机关接待用房，改造县级干部住房，添置机关交通工具，购微机、复印机等办公设备。另外，规划建设了县城民族团结健身广场，安装了高杆路灯和体育健身器材。 2002年，潍坊援藏工作开始，帮助南木林县发展教育卫生事业，提高教育水平和群众健康水平。投资90万元在秋木乡、南木林镇建设了两所希望小学，解决了秋木、南木林两乡镇学生入学难问题。针对全县中小学生课外图书缺乏问题，组织潍坊市中小学师生捐助了价值80万元的图书资料。投资30万元为南木林县医院购置了500毫安X光机和心电仪等医疗设备，提高了县医院的设备水平，加强人才培训，提高干部队伍素质。