自2001年以来，小学馆开始进行“旅游篇”特别策划。大多为每年制作一次，均为动画原创故事。均算入《名侦探柯南》TV 动画集数中。
旅游特别篇主要是为了配合现实中由JR西日本（若舞台为九州岛等地，便由JR九州支援）策划的神秘之旅活动。该活动的形式为参加者到达景点后，根据线索推理设置好的谜题。2008年后，更协助推广以JR西日本为主体的地方旅游活动。
当每次神秘之旅活动结束后，《名侦探柯南》动画中就会播出主人公搭乘同公司的列车展开旅行，到达相同目的地后遇到案件的原创故事，同时也会介绍当地的名胜和文化特色。 剧集编号海外版剧集编号剧集名称 播放时间 主要景点 收视率 236255南纪白滨神秘之旅（前篇） 2001年6月4日 白滨温泉、三段壁、白良滨（和歌山县） 14.7% 237256南纪白滨神秘之旅（后篇） 2001年6月11日 17.7% 255274松江玉造连句大战14回合（前篇） 2001年10月29日 松江城（岛根县松江市） 19.3% 256275松江玉造连句大战14回合（后篇） 2001年11月5日 18.6% 299321关门海峡的友情与杀机（前篇） 2002年11月4日 关门海峡（本州与九州交界处） 16.3% 300322关门海峡的友情与杀机（后篇） 2002年11月18日 15.3% 342368~369威斯登堡的新娘 2003年11月17日 豪斯登堡（长崎县佐世保市大湾村） 12.9% 377408桃太郎猜谜之旅（前篇） 2004年11月8日 仓敷市（冈山县） 14.9% 378409桃太郎猜谜之旅（后篇） 2004年11月15日 15.0% 419453八岐大蛇之剑（前篇） 2005年11月7日 出云市（岛根县） 11.2% 420454八岐大蛇之剑（后篇） 2005年11月14日 10.7% 518567明治维新神秘之旅（探索篇） 2008年12月1日 美弥郡秋吉台国家公园 - 秋芳洞（山口县） 8.8% 519568明治维新神秘之旅（解读篇） 2008年12月8日 7.7% 554605鹳的探索之旅小兰（搜索篇） 2009年11月7日 城崎温泉（兵库县） 9.6% 555606鹳的探索之旅（追踪阳菜篇） 2009年11月14日 10.6% 594645 广岛宫岛的七大不可思议之旅（宫岛篇） 2010年11月6日 广岛、宫岛（广岛县） 9.7% 595646广岛宫岛的七大不可思议之旅（广岛篇） 2010年11月13日 10.0% 640691八张素描画的记忆之旅（冈山篇） 2011年12月10日 仓敷市（冈山县） 9.7% 641692八张素描画的记忆之旅（仓敷篇） 2011年12月17日 9.2% 678730长崎推理剧场（幕末篇） 2012年12月1日 长崎市（长崎县） 9.1% 679731长崎推理剧场（现代篇） 2012年12月8日 11.4% 720772火与水的神秘旅行（阿苏篇） 2013年11月30日 阿苏市（熊本县） 10.0% 721773火与水的神秘旅行（熊本篇）2013年12月7日9.3%761814加贺百万石推理之旅（金泽篇）2014年12月6日金泽市、加贺市（石川县）10.1% 762815加贺百万石推理之旅（加贺温泉篇）2014年12月13日10.2%801854鸟取砂丘神秘之旅（仓吉篇）2015年11月28日仓吉市（鸟取县）7.2%802855鸟取砂丘神秘之旅（鸟取篇）2015年12月5日8.1%