现在是有的，2000年5月13日，俄罗斯总统普京签署法令，将把俄联邦89个实体（共和国、边疆区和州）按地域原则联合成7个联邦区，目的是巩固国家统一，强化总统对地方的管理体制。这7个联邦区分别为：以莫斯科为中心的中央区，以圣彼得堡为中心的西北区，以顿河罗斯托夫为中心的北高加索区（后改为南方区），以下诺夫哥罗德为中心的伏尔加河沿岸区，以叶卡捷琳堡为中心的乌拉尔区，以新西伯利亚城为中心的西伯利亚区和以哈巴罗夫斯克为中心的远东区。
21个共和国：阿迪格共和国（阿迪格）、阿尔泰共和国、巴什科尔托斯坦共和国、布里亚特共和国、达吉斯坦共和国、印古什共和国、卡巴尔达－巴尔卡尔共和国、卡尔梅克共和国－哈利姆格坦格奇、卡拉恰伊－切尔克斯共和国、卡累利阿共和国、科米共和国、马里埃尔共和国、摩尔达维亚共和国、萨哈共和国（雅库特）、北奥塞梯共和国、鞑靼斯坦共和国（鞑靼斯坦）、图瓦共和国、乌德穆尔特共和国、哈卡斯共和国、车臣共和国、楚瓦什－恰瓦什共和国；
对于你说的联邦和共和国的关系我认为是像我们大陆和香港澳门的关系吧，联邦 享有外交权和军事防卫权，包括司法权。其他的共和国虽然在经济权上有一定的权利，但属于国家性质的最高权力，都以联邦规定为最高标准。
这是由俄罗斯的政治体制造成的，他是联邦制国家。俄罗斯的政治体制就跟美国的一样，他是由联邦或是洲构成的，每个联邦或是洲有一定的自治权，有点像我们国家的香港和澳门。所以有些联邦有自己的国旗不奇怪。