您好，正常情况下是可以的，不过快递费用比较高。
首先，发快递到乌鲁木齐的话陆运是肯定行不通的，时间太久。其次，南通没有直飞乌鲁木齐的航班，所有南通快递的航空件都是从上海走的，上海有多班乌鲁木齐的航班
要和快递谈的话，四通一达这类的承包制的就没有必要了，航空资源是总公司说的算的，小的承包商没这个资格，时效和价格都没有话语权。建议和顺丰，ems，宅急送一类的直营企业谈谈，每天晚上都有到上海的班车，正常次日或者隔日就能通过空运到达乌鲁木齐，不过弊端是价格太高
走物流的话，刚查了下，德邦给的价格比较便宜2.85/kg，官网给的时效是7-8天，陆运，不知道这个时效对冷冻海鲜的质量有无影响。天地华宇，佳吉一类的价格时效都差不多。
走快递和物流是比较省心的。当然，如果搞的量比较大的话，可以直接联系上海大型的航空货运代理，省去快递公司这个中间步骤，价格相对厚道些。南通到上海的货车运费也不是很高。这个需要您自己估量下成本了
希望能帮到您