主要有几个原因，分别是经济大环境、地理环境改变、运输方式改变等三大因素。
1、经济大环境：现代经济为外向经济，以国际间的贸易为主，镇江这个古代的水上交通要道，在面对现代国际贸易时，被沿海城市比下去也是趋势。
2、地理环境的改变：京杭运河年久失休，很多地段都堵塞严重，再加上环境的破坏，降水量也在降低，基本上都是处于不能通杭的状态，只有长江还有部分的内陆航运存在。
3、运输方式的改变：在古代因为没有机动车，陆上运输主要靠畜力，运输量小，且速度缓慢，所以水上运输在古代是最便利快捷的方式，沿江的城市普遍都比较繁荣，这就叫”靠水吃水“。但现代交通是水、陆、空三位一体，机动车和高速公路以及铁路的出现使得运河运输的方式失去了竞争力，在运输量及运输速度方面都不占优势，现代运输方面，海洋运输才是水上运输的代表，而镇江不靠海，失去货运中心的优势在所难免。