目前有三个：国家劳动部、中国物流行业协会、国务院国有资产管理委员会商业技能鉴定中心
其中每个机构颁发的证书不同，如：
1、国家劳动部颁发的物流师证，共5个级别。技能级：5级为初级技能.4级为中级技能.3级为高级技能；技术级：2级为技师，1级是高级技师。
2、中国物流行业协会证书
中国物流与采购联合会同全国物流标准化技术委员会一起，根据加入WTO后与国际惯例接轨的现实，决定在全国统一推行物流师职业资格认证工作，认证的原则是“考培分离”和“六统一”，即“统一标准、统一教材、统一培训、统一考试、统一阅卷、统一认证”。考试合格后颁发全国统一编号的证书。分为助理物流师、物流师和高级物流师三个级别。
3.国际物流师认证：
国务院国有资产管理委员会商业技能鉴定中心及全国商务人员职业资格考评委员会参照世界发达国家的有关做法，按照国际惯例推出的国际物流师职业资格认证，旨在为我国培养一批懂得国际物流实务，精通国内、国际物流发展理念和实践的专业性物流人才。于2006年3月26日进行了全国首次考试。