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2005年07月13日，联邦快递与白云国际机场签署了在机场内兴建全新亚太转运中心的协议，新的转运中心取代了联邦快递原本设于菲律宾苏比克湾国际机场的枢纽地位。
新的亚太转运中心占地63公顷，总建筑面积达82000平方米。投入运作后从业人员超过800名，每周运营136个航班，在20个亚洲主要城市间提供运送服务，并通过这些城市连接全球超过220个国家和地区。
转运中心的一大特点是联邦快递拥有自己的机坪控制塔，对于一家国际航空快递运输公司而言，这在全中国也是首开先河。联邦快递可自主在地面完成控制飞机起降、停机安排及优先上落货等程序。此外，该中心的主要分拣区由16条高速分拣带、7条用于货物装载的输送带以及90部主要和次要文件分拣设备组成，每小时可处理2.4万件货物。
2008年12月17日，转运中心完成了其首次试运营。一架联邦快递麦道MD-11飞机从菲律宾苏比克湾国际机场起飞，于凌晨5:50分顺利降落广州白云国际机场。该航班由全新的运转中心负责全部地面运作，使用了联邦快递控制塔和新分拣系统。在地面流程成功完成后，该航班准点飞往其最终航点巴黎夏尔·戴高乐机场。这条亚欧航线在试运营期间每周执飞4次。联邦快递还宣布，新转运中心将从2009年2月6日正式开业运营。
2009年02月06日清晨，在最后一个航班飞往台湾后，联邦快递关闭了其位于菲律宾北部已运作了13年的的苏比克湾亚太转运中心，其核心业务已全数转移至白云机场。飞抵新亚太转运中心的首个航班来自印第安纳波利斯国际机场，这架以MD-11执飞的航班在经停巴黎夏尔·戴高乐机场后于夜里23：10分降落白云机场，标志着新的亚太转运中心的开放并全面投入运作。
签收那p 7, 2011 6:12 PM已送达BROOKLYN, NYSep 7, 2011 2:10 PM货件已装车，派送途中BROOKLYN, NYSep 7, 2011 10:38 AM位于当地的FedEx工作地点BROOKLYN, NYSep 7, 2011 10:27 AM递送例外情况BROOKLYN, NY在速递员离站后包裹才被送达递送站Sep 7, 2011 7:38 AM位于目的地分拣中心JAMAICA, NYSep 7, 2011 4:26 AM离开联邦快递工作地点MEMPHIS, TNSep 6, 2011 9:12 AM国际货件已发出ANCHORAGE, AKSep 6, 2011 8:01 AM国际货件已发出ANCHORAGE, AKAug 31, 2011 3:46 PM向有关国家机构申报过程中ANCHORAGE, AKAug 31, 2011 2:10 PM正在运输ANCHORAGE, AK可以向有关国家机构申报本货件Aug 31, 2011 1:11 PM到达联邦快递工作地点ANCHORAGE, AKAug 31, 2011 8:46 PM正在运输SHANGHAI CNAug 31, 2011 4:58 PM正在运输NARITA-SHI JPAug 31, 2011 9:22 AM正在运输SENNAN-SHI JPAug 31, 2011 1:30 AM正在运输TA YUAN HSIANG TWAug 30, 2011 10:24 PM正在运输CHEK LAP KOK HKAug 29, 2011 11:14 PM位于当地的FedEx工作地点LANTAU ISLAND HKAug 29, 2011 5:05 PM已离开发件地FedEx站点TSUEN WAN HKAug 29, 2011 4:46 PM已取件TSUEN WAN HK在FedEx截件时间之后才收到包裹Aug 27, 2011 4:11 AM托运资讯发送给FedEx