1，传统的物流管理组织机构
这种组织机构是按职能部门分工的组织形式，这时的部门划分主要以专业分类，物流的职能隶属于不同的部门，虽然有上级主管部门进行协调，但是各部门总是从各自的利益出发，从部门主管开始就很难达成一直，更不用说部门的工作人员了，这种情况导致整个工作缺乏跨职能协调，从而出现重复和浪费的现象。信息被扭曲或延迟，权利界限和责任模糊，此时还没有出现独立的物流管理功能。也没有独立的职能部门。
2，简单功能集合的物流组织形式
随着市场的不断发展，业务分割和分散化的组织使企业很难对市场需求做出快速反映，于是，企业管理者开始饿了对组织功能的合并和集合的尝试，这种变化出现在20世纪50年代。
3，物流管理功能独立的组织形式
20实际60年代末70年代初，物流管理的重要性得到饿了进一步重视，出现了物流管理功能独立的组织形式，此时将物质配送和物流管理的功能独立出来，物流部门在企业中的地位提高了。随着市场需求的逐渐加大，企业为了更快以更低的成本做出反应，纷纷建立面向零售业的物流配送中心，这是造成物流管理部门相对独立和地位提升的原因之一。
4，一体化物流组织形式
20世纪80年代，物流一体化租住的雏形出现了，这种组织结构的目的是在一个高层的领导下，统一所以的物流功能和运作，对所有的原材料和制成品的运输和存储进行战略管理，使企业获得最大利益，此时，计算机管理信息系统的发展直接促进了物流一体化组织的形成。
5，基于动态流程再造的物流管理组织
自从业务流程再造的概念提出后，适应供应链管理的组织结构逐渐从过去的注重功能集合向注重过程的重构，传统组织的改变没对基本工作流程进行任何重大的改变，在新的环境下，功能一体化的对企业获得优秀绩效的作用还有不足，由于目前所处的经营环境和所依赖的信息技术与几十年前不同，不能彻底改变原油流程就不能实现新的目标，因此，人们提出了将流程的整合作为新的工作重心，这项工作目前在欧美国家的企业中如火如荼的开展。
1、根据物流组织所处的领域不同，可划分为生产领域的物流组织和流通领域的物流组织。
1）各生产企业的物流管理机构即是生产领域的物流组织。它的主要职责是组织生产所需的各种生产资料的进货物流，产品的出厂物流，以及生产工序间的物流等。
2）流通领域的物流组织是指那些专门从事产品空间位移的组织机构，因此也可称之为专业性的物流组织。专业性物流组织的特点是：各项机构的设置，完全是以实现物流各项活动为目的的。
2、按物流组织在物流管理中的任务不同，可以划分物流管理的行政机构和物流管理的业务机构。
1）物流管理的行政机构是指那些负责制定物流管理的制度和办法，对物流的计划管理以及编制物流计划并组织实施的组织。
2）物流管理的业务机构是指那些负责执行物流计划，具体进行各项物流活动的组织，如运输管理组织、仓储管理组织等。
3、按物流管理组织的设置与职权划分，现代物流是一个极其广泛、极其复杂的系统。物流形式的多样性要求物流管理组织必须是多层次的。
1）中央一级的物流管理组织
中国中央一级的物流管理组织是国家直接设立和领导的物流管理组织。它享有物流管理的最高权限。它负有制定物流政策，下达物流计划，指导国民经济物流任务完成的任务。
2）地方的物流管理组织
地方的物流管理组织是指在各省、自治区、直辖市以至各区、县的地方物流管理机构。这种物流管理组织的特点表现为管理权限主要集中在地方。同级地方与地方的物流管理组织互相之间的联系较少或不存在联系。地方的物流管理组织负责在其管理范围内的物流组织活动并有权制定地方物流活动的政策、方法，组织物流活动的完成。地方物流管理组织有承担中央一级物流管理组织下达物流任务的义务，并有权向中央提出物流合理化的建议。
3）企业的物流管理组织
生产企业的物流管理组织是生产企业的一个部门。它的主要职责是完成生产所需要的原材料的供应和产品的销售以及半成品的物流任务。流通企业的物流组织是围绕着流通活动的各种职能所设置的，通常是流通企业生产活动的组织保证。