其一，仓储行业信息化发展缓慢。现代大型企业的经营都是建立在管理信息化的基础上的，我国仓储企业在这方面则落后很多。中国仓储协会沈绍基会长近日在“供应链改变中国”博科资讯“赢在物流”计划启动仪式暨物流管理软件全线产品发布会上指出，“我国仓储业三分之一没有自己的系统，三分之一企业使用客户的信息系统，只有三分之一的系统自主研发了系统，这些现象严重阻碍了我国仓储企业从仓库管理者、商品保管者向配送中心运营者的角色转换，更使仓储企业丢了很多大单子，影响企业的收益。”
其二，我国众多仓储企业的经济效益仍然没有根本好转。2007年、2008年，我国仓储企业虽然业务量与主营收入有较大幅度的增加，但利润却是呈下降趋势的。究其原因，大家应该都很清楚了，那就是经营成本的大幅上升。仓储服务本来就是税负较高的，再加上仓库建造成本、人力成本和折旧成本的提升，令越来越的多仓储企业苦不堪言。
其三，我国仓储行业专业分工还存在不明确的环节。仓储地产、仓储服务企业与生产、流通企业之间在信息系统联结、仓库设施建设、仓储管理、库存控制以及第三方物流公司组建方式等方面还存在着一些矛盾与冲突。同时，危险品仓储业、低温仓储业等特别仓储项目的发展与管理仍亟待加强。
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