楼主你好，目前在吴圩国际机场运营的有以下航空公司：
1、国内四大航空集团：中国国际航空、中国东方航空、中国南方航空、海南航空、以及海航集团的大新华航空；
2、地方干线航空：深圳航空(深圳航空为民营航空公司)、厦门航空、上海航空、四川航空、山东航空；
3、支线航空：鲲鹏航空(由深圳航空与美国梅萨航空集团联合组建)、长安航空(海南航空全资子公司)
4、特区航空公司：香港航空(现阶段有海航集团控股)；
5、货运航空公司：中国邮政航空。
虽然南宁有到胡志明市、曼谷、金边、马尼拉、宿务、吉隆坡、新加坡、以及雅加达的定期班机，但是尚未有国外航空公司经营这些航线。
同时确实如楼上所说，将南宁机场作为分基地的只有深圳航空。目前每天晚上只有深圳航空和中国南方航空的驻场飞机在南宁机场过夜。