先要写清具体情况，然后把原因写清楚。当碰到国际代理运输没有公司抬头发票，只有工厂提供的情况，在写情况说明时，先要写清具体情况，以表达事情的准确性，然后把原因写清楚，例如可以写尊敬的公司领导，您好，国际代理运输没有给提供公司的抬头发票，最终只有工厂给提供了，希望您能理解。
呵呵，你的客户应该是中间商吧，不想让他的客户知道实情，这个很正常；然后，你们直接发货给他的客户，也就是最终用户，是吧？
要知道，这种国际包裹是由DHL这些个国际快递来进行进出口报关的，这里就涉及到一个问题，关税（不管运费是由谁出），但是不管如何，DHL最终都要把在进口国缴纳的关税等杂费，直接向付费人收取的，一般按申报货值，也就是发票金额来计算的。
所以，考虑到：1）降低最终用户的进口成本；2）保障你的中间商客户的利益；
建议你：
1）如果是出厂价，你们应主动要求安排寄件，让客户把费用连同货款一起打给你们，然后，你们付钱给DHL，并按照USD2000.00来开发票给DHL，安排进出口报关，这样，DHL到了客户那里，就不收什么费用了，直接拿快递单签收就好了；
2）如果是USD4000.00已含运费，你们负责运输，就简单了，还是按照USD2000.00来开发票就好了，其他同上。
当然，原则是按照最低货值来申报，填发票，这样费用要少一些，前提是不能太离谱，被海关查出来就麻烦了。。。
额。。。。。。。就这么多了。。。。
码了这么多字，希望能帮到你。。。。
望及时采纳。。。
PS：如有问题，可追问。。。。。。。。