2008年11月：碍于营运状况不佳，部份车站将采“节能措施”，关闭不必要之电源，达到节能效果[11]。
2008年12月26日：配合2009跨年活动，高雄捷运12月31日营运时间延长至隔日1月1日凌晨3点，并机动调整发车班距。
2008年12月31日：2009跨年活动由于人潮众多，由当日下午6点起算至隔日凌晨3点，共计载运约30万人，创下新高，打破媒体预料。
2009年2月7日：因应消费券发放，高雄捷运推出120天畅游卡，平均一天只要30元，适合捷运通勤者使用。
2009年3月2日：高雄捷运推出爱心就业卡，适合清寒子女跟失业者才能使用。设籍高雄县市之失业劳工请领期间自3月2日起至5月31日止试办，符合请领资格者每人限请领一张爱心救业卡。
2009年3月9日：高雄捷运开通届满一周年。
2009年3月14日：高雄捷运推出霹雳一卡通“奇剑天罡”典藏套卡。是高雄捷运开通届满一周年所推出的。
2009年5月5日：2009年5月16日首度推出隐藏式的迷你卡 --“OPEN小将高雄捷运卡零钱包”。
2009年8月1日：2009年7月1日起试办一个月晨间5：50由小港站单方向发车的高铁首班车接驳服务车，提供需要搭乘高铁首班车但住在南高雄的旅客服务，由于民众搭乘需求过低，本次加班车于同年8月1日起停止提供服务。
2009年12月21日：2009年12月21日推出高捷月票1250元，购卡日起30天可无限次数搭乘捷运，但不可搭乘公车与渡轮，于2009年12月31日停止发售，将于2010年1月中旬与市府合作重新发行更优惠1250月票。
2009年12月31日：为纾解2010年跨年活动人潮，高雄捷运与市公车延长营运时间至隔日凌晨4点，末班车于凌晨4点自红橘线端点站发车，尖峰时段可达2.5分钟即有一班车，R6凯旋站跨年夜就暴增到7.1万多人次，高雄捷运红橘二线跨年当天运量高达31.3万人次，较去年成长了3.7万人次。
2010年1月1日：2010年1月1日起取消高雄捷运转搭公车优惠，并于2010年1月1日开办重大节日免费搭乘公车。
2010年4月3日：于狮甲站启用免费K书中心，于每日08:00~22:00开放，民众只要年满12岁凭有照片身分证明文件至车站服务台换取通行证即可使用。
2010年6月14日：高雄捷运红线三多商圈站、美丽岛站、左营站及橘线凤山站四处车站成立了“捷运警察队机动派出所”,协助捷运旅客各项治安服务[12]。
2010年9月19日：高雄捷运因凡那比台风影响，桥头火车站至世运站等高架站，以及地面大寮站暂停营运。
2010年9月20日：高雄捷运因凡那比台风影响，小港站至楠梓加工区站班距10分钟、楠梓加工区站以北站班距20分钟；橘线全日班距10分钟。
2010年10月22日通过评鉴，成为轨道服务业第二个和台湾轨道服务业当中最快取得经济部标准检验局交通服务业ISO9001验证。
2010年11月13日全国首创，高雄捷运音乐台K-RADIO正式上线，结合搭乘提醒语、教育宣导、生活资讯、工商广告及音乐，不同时段亦提供不同情境音乐与单元资讯，并穿插中、英文版本报时服务，贴心提醒国内与国际旅客乘车时间。
2011年1月11日监察院针对高雄捷运弊案调查后认为，前高雄市捷运局长周礼良在任内刻意曲解法令，让厂商逃避政府采购法的监督，并收受厂商不当利益，监察院今天以11票比0票通过弹劾周礼良。
2011年6月16日高雄市政府捷运局官员指出，高捷亏损逾新台币63亿元，已逾百亿元资本额的一半。市府多次行文促增资未果，已列为缺失，如高捷再不理会，将改列重大缺失。目前高捷面临之营运问题有运量不足、资金不够、土地开发与附属事业经营不善等。
2011年8月17日接手经营原统立开发经营不善之“高雄市公共脚踏车”系统业务，并由母公司中钢集团捐赠5000辆脚踏车，并维持一般信用卡借用，前一小时租借免费，之后每30分钟20元，提供24小时租赁服务。自即日起开通24小时免付费专线: 0800-255995。同时配合公共脚踏车与一卡通整合进度，并于11月底前完成票证整合，未来高捷将免费提供5,000张一卡通供民众索取，便利民众使用一卡通骑乘公共脚踏车。
2011年12月5日起，持有高捷一卡通的民众，只要携带一卡通储值卡及身分证或驾照至18个指定捷运站的服务台办理记名登录，就可以使用一卡通租用高雄市的公共脚踏车，办理登记的民众即可免费获赠尚未储值的全新纪念票卡、手机贴二选一，共8,000张供民众索取。
2012年2月1日起，若比照北捷模式，亦即在不需负担兴建成本与折旧下，高捷营运开始产生获利，唯高捷是民间自建自营公司，并于合约期满须转移政府的问题，故庞大的折旧费用与利息，造成捷运公司庞大负担，因此高捷公司公开呼吁政府，希望公平的比照高铁模式，延长高捷公司特许经营年限，以降低折旧费用，唯政府尚未同意。