EMS与机要主要有以下几点区别：
1、效率：机要比EMS快递慢。
2、安全性：机要更安全、可靠，因为机要采用的是专人押送，相对于EMS来说更加安全，可靠。
3、业务办理：EMS自己就能办理邮寄业务，但个人不能办理机要邮寄业务，机要仅针对国企、事业单位开放，不对个人以及民企私企开放。
4、查询：EMS快递可以通过快递单号在网上查询物流，但机要不能公开查询。
业务办理：
机要局只针对国企、事业单位、公务员单位开放，对个人以及民企私企是不开放了，也就是说个人想寄机要是不可以了，同时想查询机要也是不行了。
事业单位人员是事业编制，1般放在人社局，不属于公务员，公务员是放在组织部档案馆。放在人社局的就需要收费，不过如果你不转出档案的，不需要交费的，如果你要把档案转出，就要按寄存的时间长度进行收费