1、运输单位提供运输劳务自行开具的运输业统一发票；
2、由“自开票纳税人”开具的运输业统一发票；所谓的“自开票纳税人，是指符合规定条件，向主管地税局申请领购并自行开具货物运输业发票的纳税人。”
3、由“代开票纳税人”开具的运输业统一发票；所谓的“代开票纳税人，是指除自开票纳税人以外的需由代开票单位代开货物运输业发票的单位和个人。” 是指主管地税局。
以上所称代开票单位是指主管地税局。经省级地税局批准也可以委托中介机构代开货物运输业发票。
4、运输单位主管地方税务局及省地方税务局委托的代开发票中介机构为运输单位和个人代开的运输发票（包括地方税务局代开部份）准予抵扣；
5、被认定为自开票纳税人的联运单位和物流单位开具的货物运输发票也准予计算抵扣进项税额。 《国家税务总局关于加强货物运输业税收征收管理的通知》（国税发〔2003〕121号）
6、其他单位代运输单位和个人开具的运输发票一律不得抵扣。
物运输增值税专用发票，这个是一般纳税人开具的，税率为11%。如果是小规模纳税人，是不能自己开具货物运输增值税专用发票的，需要到税局代开，因小规模纳税人是按3%征收率征收增值税的，所以税局代开的发票中抵扣率是3%。
法律依据
《增值税专用发票使用规定》第三条
一般纳税人应通过增值税防伪税控系，使用专用发票。使用，包括领购、开具、缴销、认证纸质专用发票及其相应的数据电文。
本规定所称防伪税控系统，是指经国务院同意推行的，使用专用设备和通用设备、运用数字密码和电子存储技术管理专用发票的计算机管理系统。
本规定所称专用设备，是指金税卡、IC卡、读卡器和其他设备。
本规定所称通用设备，是指计算机、打印机、扫描器具和其他设备。